外部的事情处理完毕，也先准备完成自己最迫切的心愿了，而且必须尽快下手。
在他送还英宗的时候，脱脱不花汗征服了海西女真，斩杀其首领不剌吹、剌塔、别里格等人，将嫩江、松花江广大地区纳入自己控制，实力大为增强。也先再不动手，脱脱不花汗也要来铲除他这个路人皆知其心的司马昭了。
毕竟有多年君臣之义，如果毫无由头便起兵交战，有违常理。也先很容易便找了一个很好的借口：请大汗更换太子。
脱脱不花汗的正室是也先的姐姐，而他所立的太子却并非正室所生。也先名正言顺的要求脱脱不花汗将正室所生之子，也就是自己的外甥立为太子。
插手汗室的立储，这是明显的挑衅，脱脱不花汗当然知道，自己如果示弱，也先便会得寸进尺。既然早晚都要翻脸，还不如趁早动手。
1451年冬，“岱总汗”脱脱不花集合汗廷人马，并传谕各部共同讨伐也先。
大汗讨伐太师，北元顿时大乱，阿剌知院等卫拉特贵族自然支持也先，而阿哈剌忽知院、孛罗平章等黄金家族贵族站在可汗一边。
由于事发突然，也先初战不利，折了大将圭林奇，阿剌知院也受伤，只得退到杭爱山南麓休整，脱脱不花汗率军进逼，决心一举将之歼灭。
情势对也先不利，但他并不惊慌。他很清楚，能够致人于死地的，不仅仅是钢刀弓箭，还有阴谋。而脱脱不花汗身边，有人可以让他尽情施展阴谋。
也先派遣部下趁夜色潜入可汗大营，见到脱脱不花汗的二弟阿巴噶尔济，提出如果只要其临阵倒戈，杀死脱脱不花后便拥立其为汗。阿巴噶尔济利令智昏，不顾儿子哈剌苦出的劝诫，决定背叛大哥。
弟弟的背叛，脱脱不花汗毫不知情。他已经准备在1452年之前解决战争，用也先的人头作为对祖先的新春献祭贡品。那个时候，他就可以骄傲地对祖先们宣布，自己终于让黄金家族重新复兴，以后再没有权臣。他将独自率领蒙古铁骑南征北战，重现大元荣光。
他决不会想到，自己的梦想，结束在1451年12月28日这一天。
天刚刚放亮，也先的大军在阿巴噶尔济的配合下突袭可汗大营，脱脱不花汗大败，人马损失殆尽，妻子儿子全被也先俘虏。自己仅带10人逃走。
被弟弟出卖的脱脱不花汗无处可逃，只能前去投奔岳父郭尔罗斯部首领沙布丹。
被亲人出卖一次已经很可悲，脱脱不花汗却一下经历了两次。岳父沙布丹并不想为了这个已经失势的女婿得罪也先，不顾女儿的哀求，将脱脱不花汗杀害。为了不让女儿太伤心，他收养了脱脱不花的两个幼子马尔古尔吉斯、脱古斯蒙克，这两个孩子日后都被权臣拥立为可汗，但结局比父亲还要悲惨。
脱脱不花既死，那个愚蠢的阿巴噶尔济便没有了用途。也先请其赴宴商讨拥立其为汗事宜，阿巴噶尔济欣然前往，结果刚入席就掉入事先挖好的深坑当中，与护卫一起全部被杀。其子哈剌苦出虽是也先女婿，但也没能幸免，随即在逃亡路上遇害。
紧接着，也先开始政治大清洗，“凡故元头目苗裔无不见杀”，几乎将忽必烈直系子孙斩杀殆尽。除了上文所说的沙布丹保护的两个外孙之外，只有脱脱不花的三弟满都古勒因逃到合赤温后裔领地得以活命。
一切的障碍都已经排除，1453年夏，也先宰杀五头黑牛，九匹白马祭天，自立为汗，称为“大元天圣可汗”，年号“天元”。他终于完成了祖父和父亲都没能完成的心愿，成为蒙古历史上第一位非黄金家族的可汗。
当然，他不会想到，自己也是最后一位。