1932年4月18日，陕甘游击队在旬邑马家堡整休后，分编为三、五两个支队，黄子文被任命为五支队政委，闫红彦任队长，杨重远任参谋长。
同月21日，五支队按上级指示，南下武字区。黄子文到武字区后，即派人找区委负责人，商议组织农民联合会会员，配合五支队消灭马额王茂臣民团事宜。区委委员王曲贤到后，方知区委已于当月12日遭敌破坏，书记马先民被捕，王茂臣带民团逃跑，黄子文遂与闫红彦率部队进驻马额辖区的文龙堡。22日中午，武字区农联会在文龙堡召开欢迎陕甘游击队第五支队大会。“到会的三千余人，一律武装，镖如森林似的排列起来。”“农民对游击队的态度，如同出远门的家人父子团聚一样，高兴到了极点！”“大会公选黄子文同志为主席，同时代表群众（致欢迎词），在他的致词中，群众的掌声真是如雷鸣一样。删随五支队南下的中共陕西省委书记杜衡代表省委讲话。会议决定：由三原党组织、五支队和武字区农民联合会的代表七人组成革命委员会，拟在三原、富平、耀县接壤一带，开展分粮分地斗争，执行土地革命任务，取消敌区公所，解散民团，由革命委员会向苏维埃中央政府及全国各革命团体发通电等五项决议。”
至此，党在渭北建立的农民联合会游击队、渭北特委、渭北革命委员会和三原中心县委领导人民进行武装斗争，政权建设，实行土地革命，根据地全面发展。国民党得知这一情况于23日就紧急从西安调来三营兵力，又联络富平胡景铨二百人，耀县特务团上千人，分三路包围武字区，实施镇压剿洗。黄子文等分析了形势，为保存革命实力，放弃原计划，挥师北上，巧妙地甩开了敌人。黄子文此时虽知妻子李盛云已由北平返回家乡，但亦难以顾及。
同月底，黄子文、刘志丹等以中国工农红军陕甘游击队名义，向全中国革命民众发出宣言，谴责国民党军队在西安屠杀革命学生造成的“4·26”惨案，号召工农兵学武装起来，推翻国民党统治，建立民众政权，以求中华民族的彻底解放。
5月10日，三、五支队在清水原会合，恢复了总指挥部，黄子文任政治部主任。游击队北上途中，驻扎在旬邑马栏的国民党军队两个连进行阻拦。战斗打响，黄子文和闰红彦率五支队担任主攻，一举将敌全歼，缴获枪械百余支，弹药无数，有力地保障了北上活动。
6月底，因陕甘游击队在韩城转战中失利，人员减少。黄子文根据北方各省委联席会议决议中“在已开始生长成为红二十六军的游击部队中，应该毫不延缓的征调大批工人与吸收雇农、贫农及可靠的中农进去”的精神，带一班战士回武字区“扩红”，在区委负责武装工作的黄子祥的协助下，三天就有80多名青壮年报名参加，随即集中于小道口村，加入了陕甘游击队，壮大了武装力量。