那之后他在惊喜下，对组织表示可以进行人体实验后，组织才将包括沼渊己一郎在内的人体实验名单送过来被她看到。
而从她至今没有暴露来看，那位曾经的同事要么死守着APTX4869药效的秘密，要么在她叛逃后，那家研究所内跟她走的近的同事都被灭口了。
“我就说像组织那么严禁的作风，竟然会用一种没有通过人体试验的药进行灭口，怎么可能做出风险这么高的事，原来真相是这样。”听完灰原哀的回答后，阿笠博士一脸恍然大悟。
柯南也解决了心里一直困惑的地方，同时，他高速运转的大脑不由仔细思索着灰原哀刚才的话，日本公安卧底，是降谷先生的同事吗？那天晚上，爸爸邀请了赤井先生、降谷先生一起喝茶后，曾经告诉过他赤井先生跟降谷先生之间的矛盾原因。
难道灰原哀所说被清理的日本公安卧底，就是降谷先生的挚友，诸伏先生的弟弟，行动代号苏格兰，本名诸伏景光的人，爸爸说过，赤井先生说降谷先生的挚友是从他手中抢过□□后自杀。
连同有着家人亲友联络方法的手机跟自己心脏一同破坏，身为组织的卧底，日本公安，他身上不可能没有摧毁手机的武器，除非在那之前他因为某些原因失去了手里的武器，这一点跟灰原哀所说的那个卧底有共同点。
想到这柯南急忙追问道：“灰原，那位日本公安的行动代号难道是苏格兰，他女朋友叫什么，跟组织其他成员又有什么关联？为什么贝尔摩德会说那位卧底可能是利用她做跳板潜入的组织？”
“苏格兰？”灰原哀思索了下，有点迟疑的点头道：“好像是叫这个名字，至于她的名字就是今天在案发现场时曾经说过的旧名巫银，跟组织成员有什么关系就不清楚了，不过我在执行任务前一年。
刚回国进入那家研究所时，姐姐曾经说过，听说巫银是组织里一位大干部的女人，那位大干部非常纵容她，连她有其他情人都不干涉，还提拔对方之类，让我遇到这个人不要招惹，可能会有大麻烦。
现在想想可能是真的，她毒发时组织成员的神色都是慌乱中带着恐惧，贝尔摩德虽然没有露出恐惧神色，却一直皱着眉，还命令我想办法解毒，传达的任务中也从没提过要把她一起灭口的事。”
灰原哀说到这里，忽然想起了一些事，忙又说道：“对了，我记得好像还听姐姐说过，她明明不是组织正式成员，那位大干部却安排她在组织一个重要据点做店长，在那个据点的组织成员都要被她管理。”
“重要据点的店长？”柯南听了接着追问道：“知道是什么地方吗？又或者是什么场所的店长？”
“不清楚。”灰原哀摇了摇头，想了想才道：“不过姐姐曾经说过，组织的基地大部分都有训练设施比较隐蔽，但据点大部分都是酒吧之类的地方，因为酒吧那样的场所对组织行事，组织成员召集，收集情报、交换情报之类比较方便。”
“咦！你的姐姐看来真的是相当聪明，听你们说帝丹小学那次我就注意到了，你家那次连组织都没发现，现在听你一说，才知道她查到那么多组织里的事。”闻言阿笠博士不由感叹道。
灰原哀点点头：“我大部分时间在研究所，跟组织成员接触，执行任务之类的次数并不多，跟组织有关的事，大部分都是听研究所其他人的议论，姐姐跟我闲聊时说起。”
实际上或许是为了让她用更多时间进行APTX4869的研究，组织很少派遣任务给她，基本除了和APTX4869有关的任务，组织很少让她离开研究所，连每次去见姐姐，都要提前申请才行。
不过琴酒好像对自己有什么特殊想法，多次指定她参加一些任务，像人鱼岛那次就是琴酒指定她参加的，咦！回想起来，自己刚回国那两年，琴酒并没有指定自己执行过任务，他一向对研究人员不感兴趣。
第一次指定自己执行任务时，她记的是两年前的一月份，说起来距离苏格兰、巫银死期过后没多久，连一个月都不到，从那之后琴酒就经常指定她参与日本这边的任务。
而姐姐的男朋友也开始多次跟他搭档执行任务，然后没几个月就在美国暴露出了FBI卧底的身份，导致姐姐死亡的任务也给人奇怪的感觉，明明他们研究所刚汇报了研究有进步的好消息没多久。
自己给组织立下了功劳，因为自己在研究方面的能力，过去两年姐姐都没有因为那个FBI被清算，怎么在自己立下功劳后，姐姐反而接到了那个到处充满不对劲的任务？最后毫无理由击杀姐姐的人还是琴酒？
她本以为是自己坚决提出反对APTX4869人体试验的事惹到了琴酒，或者琴酒对自己有异性方面的想法，或者是想要征服自己，用各种任务染黑她之类，才会这么指定她搭档任务。
并在任务过程中对自己施加恐惧，让自己看不惯他的行为，又不敢反抗他，可如果是自己误解了？那个姐姐所说的大干部就是指组织三把手琴酒的话，岂不是从一开始，琴酒就是因为自己才针对自己周围的人呢？
因为巫银是他的女人，而自己却参与了令她死亡的任务，导致她死亡的毒药还是自己开发的？又或者是因为巫银最后是被诸星大射杀？所以自己和姐姐因为他被琴酒针对了？
姐姐最后也是被他击中心脏而死，跟那个女人的死法一模一样，那么姐姐的死、那个充满不对劲味道的任务其实都是组织BOSS默许的？
贝尔摩德是组织BOSS宠爱的人，琴酒不会对她动手，但是身为诸星大女朋友的姐姐组织BOSS却不在意，默许了琴酒的无理由杀害行为？想到这些可能性，灰原哀的神色忽然变得可怕。
一旁柯南正在想着该怎么找出那个重要据点，查出有关巫银跟那位大干部的线索，就看到灰原哀好像突然想到了什么，脸色变得苍白又可怕，不由担心的问：“灰原怎么了？你的脸色看起来不太好，想到糟糕事情了吗？”
“嗯！一个可能性，跟她有牵扯的组织干部可能是……”灰原哀握紧手中咖啡杯，开口讲出她先前想到的事，和因此产生的猜测，当然她没有提起以前一直以为琴酒在打她主意的事。
听完她的猜测后，柯南不由露出豆豆眼：“你说琴酒是那位大干部？怎么可能，那种冷酷的家伙怎么看都不像会是爱上某个女人的类型，更别说会允许自己的女人有其他情人、男朋友，还提拔对方，不可能，绝对不可能。”
“那琴酒为什么会针对我、诸星大和姐姐？”听到柯南否定她的推理，灰原哀没好气的反问。
“呃！”柯南提出另一种可能性：“有没有可能是琴酒对组织非常忠诚，因此非常憎恨组织的叛徒？而你姐姐的男朋友是组织叛徒，所以才会针对你姐姐？”
“那我呢！我是四年前回国的，在那个任务之前，近两年时间，根本没见过琴酒，更别说被他指定搭档任务，他无缘无故的，怎么会在两年后指定我搭档任务？”听柯南这么说，灰原哀立刻反驳道。
一旁阿笠博士这时开口道：“新一，我觉得哀君说的有道理。”
“阿笠博士也这么说，为什么？”听他这么说，柯南不由诧异的问。
灰原哀也看向阿笠博士。
阿笠博士回答道：“从已知的情报看，至少你查到的几个跟组织有关的人，组织叛徒都是由琴酒负责清理，所以他很可能是组织里主要负责清理组织叛徒的干部。
但是清理苏格兰时，执行人却是哀君姐姐的男朋友和另外一个人，以及那位贝尔摩德，琴酒根本没有参与，明显是琴酒被排除在这个任务之外，而作为主要负责叛徒清理的干部，有什么理由会把他排除在外呢？
我觉得很大可能是因为他跟这个卧底有某种不能参与的关系，例如他参与的话，苏格兰就相信那位女性不会真的被伤害杀死，所以不会接受组织的威胁之类。”
“但我怎么想都想象不出琴酒是那种恋爱脑，那种冷酷的家伙怎么可能？”阿笠博士说的有几分道理，令柯南不由有点抓狂。
灰原哀讽刺道：“今天之前，我也从没猜想过这种可能。”
“嘛！嘛！算了，是不是他可以以后调查，现在最大的问题是为什么已经死了的人会出现在杯户大厦？真的是她本人吗？会不会只是长得像的人，或者说是别人易容假扮的？”阿笠博士看出灰原哀对这件事的在意，连忙岔开话题问。