回到引接寺后，趁科士达不在跟前的机会，李鸿章小声对李经方、马建忠、吴永说道：“倭人想占领大沽、天津、山海关，并要我官军缴械，是想把京师团团包围，他这不是异想天开吗？倭人再凶狠，充其量不过是只狼，我大清虽不富强，可毕竟是只虎。他想把大清一口吞进肚子里，他也总该看看自己的肚子有多大，能不能吃得下。你一会儿带人起草个文书，拒绝他们提的这些无理条款。还有，起草文书的时候，不要让科士达知道。美国现在是日本的帮凶。”
李经方默默点了一下头，又道：“父亲，如果倭人坚持不肯停战，怎么办呢？”
李鸿章道：“倭人若坚持如此，老夫也无可奈何，只能先议和，后停战了。”
马建忠这时道：“老中堂，职道看日本人的态度，是要狮子大张口啊！有一样达不到要求，怕都不行啊！”
李鸿章忽然长叹一口气：“万一谈判不成，只有迁都陕西，和日本长期作战，日本必不能征服中国，中国可以抵抗到无尽期。日本最后必败求和。”
“太后和皇上能同意吗？”伍建芳小声问道。见科士达走进来，李鸿章慢慢端起茶杯。
二月二十八日，李鸿章按日方的要求，再次来到春帆楼。伊藤博文见到李鸿章递交的拒绝文书后，马上凶相毕露，说道：“贵中堂既然不肯答应我国提出的这些条件，那我国就不能停止进攻。”
李鸿章抚须说道：“这是贵国的事情，老夫做不了主。如果贵国执意不肯按《万国公法》办理，老夫也没有话说。”
伊藤博文站起身道：“好吧，既然贵中堂这么说，本大臣也没有办法，我们午后就举行正式议和会商吧。但会议期间，我国并不停止对贵国各地的继续攻击。”李鸿章听后没有答话，只是吩咐随行回驿馆歇息。日本代表刚刚退出去，科士达便对李鸿章大吼道：“你们为什么要这样？贵国既然拒绝日本的和谈条件，为什么还要来议和？”李鸿章冷静地答道：“这是中日两国间的事。”
因日方要求毫不松动，会谈无法进行下去，只得约定次日再谈。
李经方扶着李鸿章步出春帆楼以后，马上便有侍卫抢先一步来到绿呢大轿旁。李鸿章举步来到轿前，却并没有立即上轿，而是回头望了一眼春帆楼，长叹了一口气。
李经方见李鸿章心事重重，不由劝道：“父亲，先上轿吧。”这时，由春帆楼到引接寺的这条路上，正是人多的时候。
李鸿章的八抬大轿前有两名侍卫引轿，左右亦有侍卫随行保护，李鸿章的轿后则是李经方，李经方的后面是科士达，科士达之后便是马建忠、吴永等一应随行人员。除李鸿章外，其他人乘坐的全是人力车。
当李鸿章的轿子走到江村仁太郎杂货铺门前时，小山六之助见机会难得，当即从门里蹿出，旋风一般跑到轿前。轿夫不明所以，慌忙落轿，侍卫也甚是惊慌。李鸿章不知发生了什么事，急忙掀开前面的轿帘向外观瞧。小山六之助一见轿里的老人衣冠华贵，当即认定是李鸿章无疑。轿前的侍卫正诧异之间，小山六之助忽然从怀里掏出一只手枪，口里大吼了一句，对着李鸿章就是一枪。
李鸿章的左眼下部中弹，登时血流如注，官服都被打湿，很快晕倒在地。现场顿时乱作一团，行人纷纷躲避。小山六之助本想再补上一枪，哪知轿帘已经放下，何况轿前的侍卫已向他扑过来，后面的李经方、科士达等人也都跑过来。小山六之助略一犹豫，抽身便混进行人里逃走。
见李鸿章遇刺，随员们慌了手脚，急急忙忙把他抬回引接寺，随行的医生马上进行急救。
李经方、马建忠、吴永等中国员弁守在床边，科士达等所有外国人，俱被侍卫挡在门外。虽然急如笼中困兽，却也无可奈何。幸好子弹没有击中要害，李鸿章苏醒后，发现科士达等外国人没在床边，便小声吩咐李经方、马建忠等人，立即草拟函文，命人悄悄分头递交各国驻日公使馆，发布自己被刺一事。同时嘱咐随员，将换下来的血衣保存下来，不要洗掉血迹，言称：“此血可以报国矣。”同时发誓“终身不履日地”。各国驻日公使馆很快便知道了这一消息，世界登时哗然。
行刺事件发生后，马关警方很快抓到了小山六之助。但小山六之助坚称“自己无罪有功”。
伊藤博文闻讯后，亲自提审小山六之助。
伊藤博文气急败坏地大骂道：“你这个混蛋，你坏了我大日本帝国的好事！你知道吗？这一事件的发生，比战场上一两个师团的溃败还要严重！”伊藤博文话毕，对着小山六之助就是两耳光。伊藤博文为什么发这么大的火呢？原来，日本政府本来拟就的谈判方略是借战争逼迫清政府签订不平等条约，然后见好就收。李鸿章到马关后，伊藤博文最担心的就是有什么把柄落在列强手中，让一直虎视眈眈的西洋各国从中干涉，坐收渔翁之利。小山六之助的行为，恰恰无异于授人以柄。
李鸿章被抬进引接寺不久，日本方面便把李鸿章送到医院抢救。日本天皇得到消息后，马上派代表到医院慰问，又连派三名御医到医院为李鸿章疗伤。
当晚，伊藤博文在到医院看望李鸿章的时候道：“为表示对你的尊重，经请示天皇，日本决定，日中议和期间，日方可以在有限时间内，暂时停止对中国的攻击。”
伊藤博文的话李鸿章听得清清楚楚，但他却把两眼闭上，没有理睬伊藤博文。
伊藤博文离开医院后，各国驻日公使也秉承其国内的旨意，相继到医院看望李鸿章。各国医生会诊之时，日本医生建议开刀，但德国和法国医生坚决反对。理由是既然这颗子弹对李鸿章眼睛的正常工作无害，不如暂时留在体内。他们担心，如果贸然开刀，将会危及李鸿章的性命，李鸿章毕竟是耄耋老人。
但李鸿章此次伤得并不重，匪徒所用枪支系短铳，里面发射的是砂弹而非子弹。院方验伤后称，只要把眼下皮肉切开，将砂弹取出，再将养月余即可痊愈。
李鸿章不想拖延时间，他希望尽快与日本议和。经过反复考虑，他让经方向医院提出，不准医生给他动手术，只让医生将伤口缝合起来。医院经向首相请示后，只得尊重李鸿章的意见，同意按李鸿章的要求去做。李鸿章得到院方答应的当日，又派经方通知日本外务省，三日后即正式谈判。伊藤博文亦不敢不对李鸿章肃然起敬了。
双方于是在李鸿章被刺三日后便开始举行正式议和谈判。坐在谈判桌前的李鸿章，头上包着厚厚的白纱布，只露出一只右眼。医院按着当局的指令，派了两名医生跟在他的左右换药。
中国承认朝鲜独立，是大清国总理衙门向田贝允诺过的事，双方谈的重点是割地与赔款的问题。经过讨价还价，赔款数额为二万万两；经李鸿章请旨后，光绪帝照准。但日方提出割让台湾、割让辽东半岛及其附属岛屿、澎湖列岛等，李鸿章却坚决不肯答应，声称需要请旨。
谈判再次陷入僵局。
临别，伊藤博文凶狠地对李鸿章说道：“我们只能给你五天的请旨时间。如果五天后，贵中堂拒绝签字，我国便恢复战争状态。”李鸿章面无表情地站起身，在李经方的搀扶下慢慢走了出去。
当日回到医院后，李鸿章背着科士达等外国人，老泪纵横地对李经方、罗丰禄、马建忠、伍建芳等人说：“想不到，日本的胃口这么大！不仅要台湾，还要割让辽东半岛及其附属岛屿、澎湖列岛，而且缺一不可！他这是想让我大清亡国呀！”
罗丰禄小声道：“日本此次同意和议，就是既要我们赔款，还要我们的土地。”
李经方说道：“父亲，不答应他们的条件，恐怕和议不成啊！”李鸿章长叹一口气，陷入深思之中。
李经方的担心不无道理。几乎与此同时，美国驻华公使田贝又站了出来，开始配合日本，约见总理衙门大臣孙毓汶、徐用仪、恭亲王、庆亲王等，恐吓道：“日本国已向本公使表示，若贵国不肯答应日方提出的割地条款，他们就要向中国增兵，一定要打进北京来。”
就在田贝讲话的当晚，日舰突然驶向台湾，并很快对台湾进行了攻击，台湾遂被占领。光绪帝闻报之下，一边大骂李鸿章误国，一边让军机处紧急给李鸿章发电报，着李鸿章快速答应日方提出的割地条款，不准延误！一旦和议破裂，损失将会更大，失地将会更多！他这皇帝也就当到头了！电报发走，光绪又骂了许久的娘，活脱脱一个市井无赖。
李鸿章接电后，仍不甘心割让如此多的土地。他思考了一天，当晚约见了俄国驻日公使、德国驻日公使及法国驻日公使。得知三国公使来看望李鸿章，科士达急忙来见李鸿章，但却被侍卫和李经方挡在门外。
李经方说道：“很对不起科士达先生，父亲有话交代下来，他要与几位公使谈点私事，不方便外人在场。”科士达蛮横地说道：“鄙人是中堂的谈判顾问，鄙人有权过问有关谈判的所有事情！”李经方冷着脸子答道：“很对不起科士达先生，父亲与几位公使谈的话，与谈判无关。”科士达一时急得又是跺脚，又用手砸自己的胸脯。李经方、马建忠等人，却抵死不准他进去。
在房间内，李鸿章向三国公使透露了日本强索台湾及辽东半岛的内情，并特别强调说，日本只给五天期限，五天后若不画押钤印，就要继续对中国作战。
李鸿章犹豫着说：“我大清不想给日本这么多，但为了休战，只能如此。”
李鸿章当时的想法是这样的：辽东半岛不仅是俄国通商的主要地区，也是法、德两国通商的区域，李鸿章想利用列强均想在中国得到利益这一贪婪的心理，通过列强之间的争夺，达到保住辽东半岛的目的。
至于这么做后能否当真保住辽东半岛，李鸿章心里也无十分的把握，但李鸿章已经无路可走。小红私下对李鸿章说道：“老爷，皇上和太后都答应了割地的条款，您老为什么就是不肯答应呢？如果议和当真破裂，您老不成了抗旨不遵了吗？何况，您这么远来到这里，不就是为议和来的吗？”
李鸿章沉思着说道：“伊藤博文变着法子让老夫来日本，是想羞辱老夫，让老夫承认，老夫不如他。我大清打不过他小日本，但并不证明，我李鸿章打不过他伊藤博文。他伊藤博文算个什么东西！不过区区一个小岛国的首相，加起来没有新疆半个省大。老夫承认头上的相国有名无实，还不如军机大臣，但这不是老夫的错！老夫既然来了这里，不到最后一刻，老夫就不会向他伊藤博文低头！”
小红嘴上不说什么，但心里却很是替李鸿章担心，她真怕心狠手辣的慈禧太后盛怒之下，会对李鸿章下狠手。日本强索辽东半岛及台湾的消息一经传出，果然在俄、法、德三国间引起强烈反响，因为日本的这一举动，确实伤害到了他们三国在辽东半岛的利益。
首先有反响的是俄国。俄国经过论证认识到，中国割让辽东半岛，将直接威胁到俄国已有的利益。俄国财政大臣维特分析道：“日本侵占辽东半岛，其锋芒主要是冲着俄国。”
维特最后建议：“我们应坚决声明，不能允许日本占领南满，假使不履行我们的要求，我们将采取适当的措施……如果有战争的必要，我们就坚决行动。现在决定开战，对于我们有利得多，否则俄国在将来就会遭受更大的牺牲。”
维特的建议得到俄国沙皇的赞同。日本限定的五天期限很快到了。这一天的上午，李鸿章与伊藤博文尚没有坐到一起，驻日的俄、法、德三国的公使，便秉承各自国内的指示，联合照会日本外务省，要求日本放弃占领辽东半岛。照会同时申明：如果日本表示拒绝，即由三国海军切断辽东日军和本国之间的联系，使其陷于孤立。
大清国总理衙门也在同一天，接到俄国驻华公使的照会，劝阻中国不要按着日本的期限即行画押，俄国已联合法、德两国决定干涉此事。
俄、法、德三国驻日公使也在照会日本外务省之后，向李鸿章通报了此事。当晚，俄国公使又通知日本外务省次官林董，称：“接到国内的指令，现停泊在各港的俄国军舰昼夜升火，禁止船员登陆；俄国东部西伯利亚总督急召预备兵入伍，集合五万人，随时准备出动。”
面对俄、法、德这突如其来的联合干涉，日本政府感到十分惊慌。
伊藤博文紧急约见三国公使，希望能通过谈判解决此事。但三国的公使一致表示，除非日本决定放弃辽东半岛，否则无话可谈。
伊藤博文无奈之下，只好让陆奥宗光分别照会俄、法、德三国公使馆，声明：“日本帝国政府根据俄、法、德三国政府之友谊忠告，决定放弃对中国辽东半岛之永久占有。”随后，日本又正式向三国要求，由清政府偿付白银五千万两作为还辽酬报。
德国公使经请示国内后表示同意，俄国公使则把这一情况通报给了李鸿章。李鸿章一口否决。俄国公使于是以“公允”的口吻提出了三千万两的折中数字。李鸿章把情况电告总理衙门，总理衙门转日即电发“允准”的旨意。