不出陈文运所料，傅良佐督湘的明令一发表，立即招致湖南和西南各省的反对。他们认为傅良佐虽然是湘籍，但自幼便随父随宦在外，无论过去的出生之地，还是现在的做事方式，都只能被归入北人之列，不符合“湘人治湘”的要求。
陆荣廷出面给冯国璋发来一份电报，要求收回成命，并主张划湖南为南北军的缓冲地带，继续维持湖南现状。
冯国璋由于已同意段祺瑞派傅良佐督湘，故而难以作答，只得把陆荣廷的这份电报交给段祺瑞。段祺瑞以国务院名义答复陆荣廷，把更换湘督说成是“为事择人”，拒绝了对方的要求。
1917年8月下旬，傅良佐以“衣锦归乡”的姿态，辞别段冯，离京前往湖南就职。
段祺瑞在发表任命时，曾表示傅良佐虽督湘，但不带北军入湘。可是面对各界如此强烈的反对，如果真的让傅良佐一个光杆司令入湘，段祺瑞自己也不放心，为此他在傅良佐赴任的同时，就派了两个师的北洋军开往湖南。
谭延闿内心不是不想抵抗，但原本答应援湘的桂滇军还没行动，北军已经大兵压境。至于湘军，只有两个装备较差的师，而且谭延闿还只能控制其中的半数，自然无法抵御北军。
在此情况下，谭延闿只得放弃抵抗。有人问他是否愿意留任省长，谭延闿说：“当惯了婆婆，如何能做媳妇？”
傅良佐到长沙后，谭延闿一俟办完交接手续，马上借口回籍省亲，离开长沙到上海去了。
谭延闿绝非俗辈，当年曾与谭嗣同等人并称为“湖湘三公子”。离职之前，他在与西南各省加强联络的同时，派原零陵镇守使望云亭赴京迎接傅良佐，望云亭的职务则由刘建藩署理。
谭延闿的举动表面看上去似乎是对北京政府的服从，其实暗藏机锋——望云亭是段祺瑞留在湖南的一个内线，把他调走乃为调虎离山之计；继任的刘建藩参加过“二次革命”，让他镇守零陵，无异于埋下了一颗反对傅良佐的定时炸弹。
傅良佐在就职的第四天也发现了谭延闿所布的这着棋，于是下令撤换刘建藩。刘建藩早有准备，不仅拒绝从命，而且通电全国，宣布独立。
消息传到长沙，傅良佐立刻慌了手脚，一面宣布长沙戒严，一面派兵前往讨伐。不料派去的本省军队全是软脚蟹，没几下就纷纷溃败。
傅良佐再命随其南下的那两个北洋师出战。北洋军久经沙场，炮火又相当猛烈，非刘建藩等所指挥的湘南军队所能抵御。在湖南地方的屡次请求下，10月中旬，西南方面组织湘、粤、桂联军，分路向北洋军发起反攻，湖南问题迅速演变为南北战争。
与南北战争相伴随的，是第二次府院之争的正式浮出水面。自傅良佐督湘事件以后，冯段就产生了隔阂，而且从此一天天地加深。
段冯本来当面接触的机会就不多，这时候越发少了。难得有一次，冯国璋突然打电话给段祺瑞，请他到府里来谈谈。段祺瑞接了电话说：“一定是四哥想打麻将了！”说完便高高兴兴地带了两百元现钞赶去总统府。
段祺瑞喜欢打麻将，但一般都在晚上下班之后。这次他上班也要打麻将当然不是纯粹为了玩，而是希望利用打麻将的机会重新加强二人的私人联系，冲淡彼此感情上的不愉快。
可是冯国璋在和他谈完公事之后，却并没有谈到打麻将的话。段祺瑞也不便提出，只得乘兴而去，败兴而归。
冯国璋本人其实不爱打麻将了，他也知道段祺瑞的癖好，但就是不肯迎合对方打上那么几圈。这也使得段祺瑞不能不怀疑“四哥”是在摆他的总统架子。
后来又有一次，段祺瑞主动去拜访冯国璋。当时恰巧府内有一处木桥坏了，段祺瑞的汽车无法通过。有了打麻将的尴尬经历，段祺瑞自然而然地认为冯国璋仍在故意摆阵势，不准备和他见面，于是当即就命令车夫掉转车头，愤然打道回府。