在传说中，中医学是黄帝和他的大臣岐伯所创立的，所以后世把黄帝和岐伯尊为医祖，甚至把中医学称之为岐黄之术。《黄帝内经》便是以黄帝和岐伯问答的形式写成的，约成书于战国晚期(一说汉代)。
《黄帝内经》包括《素问》和《灵枢》二部分，以论述人体解剖、生理、病理、病因、诊断为重点，兼述针灸、经络、卫生保健等方面的内容，是中医学的一部著名经典著作。它奠定了中医学的理论基础，至今仍是学中医的人所必读的典籍之一。
《黄帝内经》把阴阳五行学说引入医学，使其成为医学的基本理论。书中说：“阴和阳，是天地的根本法则，是万物的纲纪，是变化的父母，是生与杀的本始，是精神寄藏的寓所，所以治病就要探求阴阳这个根本。”由此，书中提出对于人体健康，最根本的是要保持阴阳的平衡，如果阴阳失去了平衡，人就会生病。治病疗疾的宗旨，就是用各种方法使破坏了的平衡重新恢复起来。同时，《黄帝内经》把人体视为一个完整的整体，各部分的器官都是有机地联系在一起的。某部分发生病变，将会影响到全身及其他器官，而全身的状态也可能影响局部的病理变化。五行在书中也得到充分应用，五行的相生、相克、相乘(有乘虚侵袭之意)、相侮(有恃强凌弱之意)，被用来论述人体疾病的各种起因。书中说：“五行者，金木水火土，更贵更贱，以知死生。”这里的“贵贱”是指盛衰的意思，就是说以五行的盛衰来观察身体的健康与疾病。
《黄帝内经》对人体与外部环境的关系也非常重视。它强调指出，人的身体状况与四季变化、昼夜交替、地理水土、社会生活以及精神状态等都有着密切的联系，因此在诊断和治疗中也必须考虑这些因素，因时、因地、因人分别施治。这一诊断和施治的指导思想，已为现代医学和生物学所证实。