古代玛雅人居住在中美洲地区，即今墨西哥的尤卡坦半岛和危地马拉、洪都拉斯境内。在众多印第安部落中，以玛雅人的社会发展水平最高，堪称世界古老文明部落之一，是美洲文明的摇篮。
据资料显示，公元前2000年左右，尤卡坦半岛已经有了人类居住的痕迹。这些人类他们以渔猎和采集为谋生手段，创造和发展了自己的历史。公元前1000年左右，又以玉蜀黍为主要农作物的农业生产开始发展起来，之前的那些人于是开始过上了定居的生活。然而这种文化究竟是不是玛雅人创造的，至今仍然没有一个定论。公元初，玛雅人在尤卡坦半岛南部建立了城市，此后的七八百年间又不断地在进行建筑，总共建立了100多个城市。而在那些城市的广场上，玛雅人学会了进行日用品和食品的简单交换。这就标志着玛雅人已经进入了阶级社会。
公元10世纪以后，一支托尔提克人从墨西哥侵入到玛雅地区，在尤卡坦半岛上建立了一些新的城邦。自此，玛雅文化便出现了第二次繁荣兴盛。
玛雅人在美洲创造了高度的文明，其全盛时期大约在公元4～10世纪。此后玛雅文化遭到了明显的践踏和蹂躏，只有尤卡坦半岛北部还得以保存和持续发展，直至公元15世纪欧洲殖民者入侵这一地区，玛雅文化的独立发展才被打断。
神秘的玛雅文化给我们留下了不少神奇的遗址。玛雅文化的重要遗址分别位于墨西哥中部高原的特奥提华城、尤卡坦半岛南端乌苏乌辛塔河流域的科班城和尤卡坦半岛北部的乌斯马尔城。它们分别属于古典时期、早期和晚期的奴隶制城邦遗址。
通过考古发现，这些城市规模宏大，有的城市长宽均达数公里。城里耸立着大量金碧辉煌的神庙和宫殿。在建筑物的墙壁、柱子、梯阶和石碑上有精美的雕刻，有的地方还发现了栩栩如生的壁画，描绘了庆祝游行、呈献贡赋、押送战俘、争夺格斗等场面，表现了玛雅人高度的艺术成就。除此之外，多层次的金字塔台庙建筑，光怪神奇，令人赞叹不止，如乌斯马尔城的几座多层次金字塔，反映了玛雅人对地球的原始观念。他们将地球上部分成若干层，每层有13个世界；地球下部也是如此，每层有9个世界。各层分别由“界神”来掌管。
玛雅人信奉太阳神、月神、蛇神、风神、雨神、地神、农神等。他们用占卜的方式勾通人与神的联系。玛雅人祭神的规模很大，祭品除牲畜、飞禽、瓜果外，还曾一度盛行人祭。
公元前后，玛雅人便创造了象形文字，包括许多象形符号和音标、音节符号，它们一般用小毛笔书写在无花果树皮上。科班城建筑群中著名的“象形文字梯道”，是玛雅人特有的具有纪念意义的建筑物。不过，留传到今天的玛雅文字，大部分是镌刻在石碑、陶器、骨器上的铭文，迄今依然无法辨认。
玛雅人创造的太阳历法，规定每年为365.2420天，而现在天文学家的准确计算是365.2422天，一年的误差不过是0.0002天，这种精确程度恐怕很难用巧合来解释。
此外，令人更加迷惑不解的是，在洪都拉斯一座神庙的壁画中，人们发现画面中有玛雅人乘坐一种类似今天火箭的飞行器邀游太空的形象。我们知道，不管是多么夸张的艺术，总是建立在一定的物质基础上的。那么，我们是不是就可以据此断定，玛雅人已经早于我们几千年提前进入了太空时代呢？如前所述，玛雅人具有超时代的天文科学知识，他们创造的太阳历比格列高利历更准确，更贴近回归年长度。从现有的文字手稿中，我们还可以发现玛雅人预测数十万年间日食、月食的表格和标明流星陨石坠落的时间表。这些事实表明，玛雅人的智慧，大大超越了人类文明发展的特定历史时代。
据此，有的学者推测，是外星人创造了玛雅文明，玛雅人的祖先原本就是进入地球的外星人。另一些学者则对玛雅文化与亚洲古代文化之间的历史渊源进行了广泛而深入的探讨。通过两种文化的对比研究，发现二者之间有不少相似之处。
人类学家发现，印第安人的肤色和体形与亚洲蒙古利亚人种相似，因而一般认为他们属蒙古人种。
有人考证，古印度著名史诗《摩诃婆罗多》曾有过“地球另一隅的人”的记载，这些人可能就是进入美洲的亚洲人。这些人进入美洲之后，在墨西哥、危地马拉、秘鲁、洪都拉斯等地经过长期发展，虽然逐渐形成了与印度各自不同的文化体系，但是，他们却有着大致相同的神祗和信仰，如对日神、月神、蛇神、风神、雨神、海神、地神的信仰等就是最有力的佐证。印度古代的大佛塔“窣睹坡”与墨西哥等地的大型金字塔台庙形象十分相似，这也是很难用巧合来加以解释的。
基于上述这些理由，有人便提出了亚洲人是玛雅文化的创造者之一的观点。
由于美洲没有发现远古人类生活的遗迹，关于美洲人种究竟来自何方的问题，很多年来，学者们一直众说纷纭。近年来一般认为，印第安人是从亚洲东北部移居美洲的，属于蒙古人种的一支。也有人认为，有一部分印第安人属澳人利亚一美拉尼亚人种，是与蒙古人种的一支同时或更早移入美洲的澳洲人。
据测定，他们移居美洲的时间大约在四五万年以前。其迁移动机可能是追踪野兽或者由于气候突变。为了生存，他们从亚洲出发。向着太阳升起的方向前进，越过白令地峡（最近一次冰河时期，当时的白令海峡比今天约低100米）抵达美洲大陆。后来海面逐渐升高，地峡变成海峡，迁移的人便踏着海峡的坚冰，沿海边航行进入美洲。不过，这种移民是一个非常漫长的历史渐进过程，决非一次两次的挺进行动所能完成的。
上述种种观点，孰是孰非，还有待学者们的进一步研究，轻率的结论只能是科学探索领域的最大误区。
在尤卡坦半岛上，耸立着九座巍峨的金字塔。这些金字塔与埃及最早的几座金字塔相比，可以说是孪生的姐妹。同类的建筑在英国和法国也已发现。
金字塔各种数据的精确程度让我们惊叹不已。苏格兰天文学家斯穆斯对埃及的两座金字塔做了为期四个月的测算，他们得出的一些数据发人深思：塔的四个面都是等边三角形，它们正好是东南西北四个方位；底边与塔高之比，恰好为圆周率与半径之比；塔的高度为地球赤道周长的二十七万分之一，也是地球到太阳距离的一万亿分之一。
然而，玛雅人的金字塔的天文方位计算得更加精确：天狼星的光线经过南墙上的气流通道，直射到长眠于上面厅堂中的法老头部；北极星的光线通过北墙的气流通道，径直射入下面的厅堂里。
很多人都认为金字塔是一座坟墓，而且在很多金字塔中也确实找到了木乃伊。那么，大西洋两岸的古民族会不谋而合都来营造这种工程浩大的金字塔吗？
如果真是这样，那么为什么金字塔与塔顶上的神龛是如此不相称，整个金字塔的建造水平是如此之高，而神龛却十分粗糙，这不仅使人想起神龛可能是后来加上去的。100多年前，从金字塔中发掘出来的东西，今天已经有一部分被人们辨认出来了，原来是一些精致的透镜、蓄电池、变压器、太阳系模型碎片、不锈钢和其他一些不知什么合金制成的机械和工具等。
据此，有些人推测，金字塔原先可能是一种玛雅祖先的供应库，只是由于金字塔内部的奇特空间形状，能使停放在金字塔内一定部位的尸体木乃伊不腐坏，因此头脑中存在着永生渴望的民族，要把自己的首领放进这种供应物已经用完的现在建筑物中，是完全可以理解的。与埃及金字塔不同的是，尤卡坦半岛上的金字塔更像一个祭坛，由此看来，它的功用不仅仅是国王或首领的坟墓。
1942年3月，美国总统罗斯福接见了刚刚从墨西哥的恰帕斯州进行考古研究回来的戴维·拉姆夫妇。拉姆夫妇给总统带来了一个惊人的消息：他们终于发现了，传说中守卫墨西哥地下隧道的白皮肤的印第安人。
据拉姆夫妇回忆，当他们横穿当地密林时，被一些皮肤呈蓝白色的印第安人包围，并要求他们立即按原路返回。而他们早就听说，在恰帕斯的腹地存在着旱已荒废的玛雅古城。在这些城市地下分布着构成网络的隧道，他们此行的目的就是要查出这种传闻的真相。
17世纪，一位西班牙传教士发现了中美洲危地马拉的一条地下隧道。从地图上看，它位于安第斯山脉地下，长达1000公里以上。为了保护隧道，等将来人们掌握了足够的科学技术再来开发，这些被发现的地下隧道的入口又被秘鲁政府封闭并严加看守，随后又被联合国教科文组组织列为世界文化遗产。
德国作家冯·丹尼肯曾经进入过这个隧道。在隧道中，他无不惊讶地见到了宽阔、笔直的通道和涂着釉面的墙壁。多处精致的岩石门洞和大门，加工得平整光滑的屋预，面积达两万多平方米的大厅，以及许多每隔一定距离就出现的平均1.8米至3.1米长、80厘米宽的通风井。隧道内还有大量奇异的史前文物，包括那本许多民族远古传说中提到的金书。这些发现让这位以想像大胆著称的作家惊得目瞪口呆。他毫不怀疑地相信，这是这个世界上最宏大的工程；也是世界上最大、最难破解的谜题。
丹尼认为，隧道是用高科技的超高温钻头和电子射线的定向爆破以及人类现在还不具有的某些技术开凿而成的。
无独有偶，英国考察队在墨西哥马德雷山脉也发现了地下隧道，这条隧道可通往危地马拉。每当拂晓，地下隧道便会发出敲鼓一样的声音，声震远方；前苏联阿塞拜也发现了一条古代地下隧道，隧道里有一些20米多高的大厅，还有很窄的拱形门。据说洞中会不时发出奇妙的声音和光。
20世纪70年代，人们在南美洲发现了一条玛雅人的古隧道，据估计，它至少有5万多年的历史了，而实际上它的年代可能更为久远。这条隧道离地面250米深，仅在秘鲁、厄瓜多尔境内就有数百里长。隧道的秘密入口由一个印第安部落（古代玛雅人的后裔）把守着。他们说，这里是“神灵”居住的地方，他们必须遵守祖训，世世代代守在这里。
在古隧道里，考古学家们发现了大量远古文物，这些物品安放在隧道里的许多洞穴中。更令考古学家们兴奋的是，他们还发现了一些刻有符号和象形文字的金属叶片以及不同形状和色彩的石器和金属制品。遗憾的是，直到今天还没有人能破译这些文字。
隧道的穴壁光洁平滑，似乎经过磨光，与地面成直角。穴顶平坦，仿佛涂了一层釉，不像是天然形成的，倒像是某种机械削切的结果。隧道中有个“大厅”，长164米，宽153米，里面摆放着像桌子、椅子似的“家具”。奇怪的是这些物品的材料很特殊，既不是钢铁、石头，也不是塑料和木材，而它们却具有钢铁和石头那样坚硬和笨重，在地球上至今还没有发现过这种材料。“大厅”里面也有很多金属叶片，大多在长约100厘米，宽50厘米之间，厚度约2厘米，一片一片排列着，像是一本装订好的书。金属片上都写有很多符号和象形文字。据专家认定，这些符号是机器有规律压印上的结果，目前已发现3000多片。
隧道里还有很多用黄金制作的图案，其中有两块雕刻的是金字塔。每个金字塔旁边都刻着一排符号，还有一个用黄金雕刻的柱子，这个柱子长52厘米，宽14厘米，厚3.8厘米，柱子上刻有56个方格，每个方格里都刻有奇怪的符号。
古代玛雅人为什么开凿如此工程浩大的隧道呢？里面的物品和文字又隐藏着怎样的秘密呢？
据考古探测和远古文献记载，考古学家推断地球上很可能有一条穿越大西洋底，连接欧、亚、美、非的环球地下隧道，这些古隧道又很可能是古代玛雅人的杰作。
在世界古代文明中，生活在中美洲的古代玛雅人所创造的文明最令人感到惊叹不已和迷惑不解：它们似乎是从天而降，在公元3世纪到9世纪达到了鼎盛，随后却戛然而止。
人们无法了解公元9世纪这100年间到底发生了什么，人们只知道其间玛雅人修建的各种浩大工程金字塔、宫殿和神庙都突然停止了施工，所有玛雅人仿佛接到了某种神秘指令，舍弃了辛勤修筑的家园而向更加荒芜的深山迁移。这是玛雅人留给后人的谜题，不仅如此，玛雅人还留下了另一个更加让人匪夷所思的谜团——神奇诡秘而又鬼斧神工的水晶头骨。
在美洲印第安人中流传着这样一个古老的传说：古时候有13个水晶头骨，能说话，会唱歌。这些水晶头骨里隐藏了有关人类起源和死亡的资料，能帮助人类解开宇宙生命之谜。传说里还提到，总有一天人们会找到所有的水晶头骨，把它们聚集在一起，集人类大智慧于一体，发挥它们应有的效用。根据传说，人们必须在2012年12月21日之前找到全部头骨。那一天是已经循环了5126年的玛雅历法的终结。除非13个头骨聚集在一起并按正确的位置摆放，否则地球将飞离轴心。只有那样做，头骨的超自然力量才能挽救地球。这个传说在美洲流传了上千年。一直以来，人们都认为它只是一个美丽的神话或者只是天方夜谭而已，很少有人想过这种水晶头骨会真的存在，更没有人知道传说中的水晶头骨到底是什么。从传说的内容来看，它像是一个包罗万象的信息库，也像是一部无所不知的天书，但人们对它一无所知。
然而，19世纪欧洲的探险家们却对这个传说深信不疑，尽管一直没有人找到过那些传说中的水晶头骨。直到1927年，英国姑娘安娜在她生日那天，终于发现了一个惊人的秘密。
安娜的养父米歇尔·黑吉斯是英国的探险家、大英博物馆玛雅文化委会员的成员，对玛雅文明痴迷到了近乎狂热的地步。1924年，米歇尔组织了一支探险队从英国利物浦出发，沿水路到达中美洲，与他同行的还有他心爱的养女安娜。
探险队在当地玛雅人的帮助下，终于在今天中美洲的伯利兹荒无人烟的热带丛林中，发现了一处古代玛雅人的城市遗址。这是一座被藤蔓和大树湮没了的古城，探险队用了整整一年，才使得这座古城得以展现它昔日的风姿。
这座古城废墟让米歇尔惊呆了：城堡的高度远远超过周围的村庄，高达150英尺，占地6平方英里，包括金字塔、宫殿、墓冢、城墙和地下室，城堡的每个地方都是用割好的白石头砌成的，玛雅人竟然凭着原始的石斧创造出了工艺如此精湛的作品，其劳动强度简直无法估量。
从小受到养父的影响，17岁的安娜也对眼前的一切感到兴奋不已，她小心翼翼地爬上了城堡最高点的金字塔顶，一览热带丛林的绚丽风光。正是因为她这种强烈的好奇心，才使得玛雅人的一个旷世之谜得以重见天日。
当安娜正在饱览迷人风景之时，她突然发现金字塔的裂缝深处有一个东西闪闪发亮。她立即告诉了养父，米歇尔急忙带着探险队的全体成员登上了金字塔顶，把裂缝边松动的石头移开。经过几周的努力，他们终于刨开了一个可以让一个小个子进出的窟窿，安娜只身爬入这个窟窿的底部，她突然发现一个东西照亮了她的脸，仔细一看，是一个犹如人头骨的水晶，她兴奋极了，把它带回到了金字塔顶。
安娜发现的宝物是一块通体透明的水晶头骨的上半部分，米歇尔命令队员们继续挖掘。3个月之后，他们在25英尺外的地方又找到了水晶头骨的下半部分，两块头骨合在一起，正好与真人头骨一般大小。
这个水晶头骨长17厘米，宽和高各是12厘米，重量有5公斤，它是用一大块完整的水晶，是根据一个成年女人头颅的形状雕制而成的。它做工非常精细，鼻骨用三块水晶拼成，两个眼孔处是两块圆形的水晶，下颌部分可以跟头盖骨部分相连，也可以拆开。这真是一件巧夺天工的艺术极品。
按照惯例，米歇尔将水晶头骨献给了当地居民的首领。而当米歇尔的探险队将要返回英国时，当地的首领又将水晶头骨回赠给了米歇尔，以回报探险队给他们提供药品和食物的帮助。后来人们就把这颗头骨称作“米歇尔·黑吉斯水晶头骨”。米歇尔去世后，这颗头骨就一直由安娜珍藏。
水晶头骨的横空出世，牵动了全世界考古学家们的神经。他们把水晶头骨和真正的人类头骨作了比较，发现除了眼部特征稍稍偏于人类的正常范围以外，其他参数都和真正的人类头骨相差无几。我们知道，近代光学产生于十七世纪，而人类准确地认识自己的骨骼结构更是十八世纪解剖学兴起之后的事情。很显然，这个水晶头颅应该是在非常了解人体骨骼构造和光学原理的基础上雕刻成的，那么，一千多年前的玛雅人是怎样掌握这些高深的解剖学和光学知识的呢？
据说，水晶头骨还具有催眠功能，如果一个人紧盯着水晶头骨的眼睛处，不多时人便会产生昏昏欲睡的感觉，传说头骨是玛雅人为病人做手术时催眠病人用的。
一位玛雅老人告诉米歇尔这颗水晶头骨至少有10万年的历史了，是为了纪念一位伟大的玛雅祭司而制作的。然而却没有多少人相信他这一说法。科学家们试图弄清楚它确切的制作时间，但是石英水晶的物理属性决定了它永远不可能被知晓。
我们都知道，水晶是世界上硬度最高的材料之一，用铜、铁或石制工具都无法加工它，而1000多年前的玛雅人又是使用的什么工具呢？此外，这种纯净透明的水晶虽然硬度很高，但其质地却脆而易碎，因此科学家们推断：要想在数千年前把它制作出来，只可能是用极细的沙子和水慢慢地从一块大水晶石上打磨下来，而且制作者要一天24小时不停地打磨300年，才能完成这样一件旷世杰作。
经研究证实，这个水晶头骨是利用某种碰撞力量雕刻成的，但现在科技还没有掌握这种技术。从这个奇异的水晶头骨来看，玛雅人已经掌握了相当高超的工艺技术。现代人引以为傲的工艺技术跟这个水晶头骨比起来，真是黯然失色、不值一提！以现代的科学理论与技术发展速度来看，我们恐怕至少还需要五十或上百年才能跟得上玛雅人的科技水平呢！难道玛雅人真的制造出了这些神奇的水晶头骨吗？
在安娜看来，玛雅人是出于某种原因才把水晶头骨赠与她和她父亲的。至于是什么原因，只能靠时间来慢慢说明了。安娜说：“玛雅人告诉我，这个头骨对人类有着重大意义。这是玛雅人送给全世界人民的礼物。玛雅民族学识渊博，他们给我们这个头骨是有一定原因和目的的。我不确切地知道那个原因，但我知道这个水晶头骨和非常非常重要的一件事有关。”
考古学家们在谜一样的玛雅遗迹中搜寻多年，找到了大量令人称奇玛雅文物。然而最令人惊讶的是，其中有些可以辨识的竟然和今日的尖端科技非常接近。
1948年到1952年间，墨西哥籍考古学家路利教授在巴伦杰神殿的“碑铭神庙”中，发现在巨大石室的墙上刻有九位盛装的神官以及一位带有奇妙头饰的青年浮雕。
经过仔细观察，路利教授发现这个浮雕与现在的太空船非常相似！浮雕中的图画中，是一位青年正在操作一台机器，这个机器的前端是流线型的，看起来相当精密复杂，还有类似仪表的东西。青年头戴头盔，头盔上有两条管子接着。他弯着腰和膝盖。双手正在操纵一些操纵杆，位置较高的一只手正在调节把手般的东西，较低那只手的四根指头，在操纵类似摩托车把手般的控制器。二目前视。左脚跟搁放在有好几道槽痕的踏板上。青年后面有个类似内燃机的设备。内燃机箱后方可以看到有火焰喷出。路利教授在巴伦杰神殿所发现的浮雕和玛雅碑文有密切的关系。被解读出来的碑文中，有一节是这样描述的：“白色的太阳之子，仿效雷神，从两手中喷出火……”
可能有人会说，这段话恐怕是古代玛雅人对太阳崇敬所想像出来的情景。但是根据路利教授所发现的石雕以及碑文中的记载，仔细想想，这个浮雕看起来与登陆月球的登月小艇真有几分相似呢！如果这张图真的是当初玛雅人照着他们建造的机器画上去的，那么说明他们已经具备了从事太空探险的能力。或许那些精密的历法，正是遨游太空的玛雅人所需要的。
公元761年，杜斯·彼拉斯城的王宫覆灭可以看做是玛雅社会衰落的一个起点。杜斯·彼拉斯是方园1500英里内的中心城邦。公元761年，它遭到来自邻近托玛瑞弟托城的敌人的攻击。一个装有13个8岁至55岁的男人的头颅的洞证明了该城被攻占时遭到了斩草除根的大屠杀。8天后（这些精确的细节被记录在石头刻板上），胜利者举行了“终结典礼”，砸烂了王座、神庙和刻板。一些贵族逃往附近的阿瓜迪卡城——这是一个巨大裂缝环绕的天然要塞。这些潜逃的贵族在那里苟延残喘了40年，最后还是遭到敌人的攻占，陷入了灭顶之灾。公元800年，阿迪卡已经成为一座鬼城。公元820年以后，玛雅人舍弃了这片千年间建立了无数城市的佩藤雨林，再也没有返回这片文明的发源地。玛雅文明的毁灭已成为历史，但它提供的警示，值得人类永远记取。
今天，仍有200万以上的玛雅人后裔居住在危地马拉低地以及墨西哥、伯利兹、洪都拉斯等地。但是玛雅文化中的精华如象形文字、天文、历法等知识早已消失殆尽，没能留给后代。
玛雅人创造了灿烂辉煌的玛雅文明。公元800年前后，玛雅人放弃了高度发展的文明，大举迁移，文明很快消失于美洲的热带丛林之中。直到目前为止，几乎整个玛雅文明都笼罩着一层谜，就像在拒绝我们去解析一般，把自己闭锁于阴沈的黑暗中。的确，有关九世纪时，玛雅灭亡的假设层出不穷，比如洪水、地震、飓风等等的天灾说；瘟疫、集体中毒等等传染病说；人口膨胀、反覆从事焚林耕作导致土壤贫瘠等等经济问题说；外敌入侵、都市间战争、农民叛乱等等社会问题以及集体自杀说等等不胜枚举。但是，关于玛雅文明中断的原因，至今仍然是众说纷纭、莫衷一是。目前有以下几种比较流行的说法：
1.干旱说
这是目前最为流行的一种看法。玛雅文明之所以突然中断，是由于当地连年发生干旱，摧毁了古文明赖以生存的农业基础。而玛雅人又没有打井竖渠的水利知识，在湖泊河流干涸断流之后，农业的歉收引起了一系列的连锁反应，导致巨大的都市文明最终分崩离析。但是导致尤卡坦半岛旱灾频发的原因是什么，一直成为学术界争论的重点。
2.砍伐森林说
一些专家指出，玛雅人有着复杂的宗教体系，城市都是以金字塔和神庙为核心的。在兴建金字塔和神庙时，玛雅人习惯于用白石灰来粉刷外墙，烧制石灰需要大量木材，玛雅人便开始大规模地砍伐森林。随着城市规模的不断扩大，金字塔修建得日益增高，对木材的需求量也越来越大，最后，大片森林被砍伐殆尽，当地的环境也随之逐渐恶化，干旱自然不可避免。对此，广泛分布于墨西哥南部和美洲各国的玛雅金字塔遗迹，就是最好的证明。
3.生态危机说
玛雅文明虽然属于城市文明，但却建立在玉米农业的根基之上。自古以来，玛雅农民采用一种非常原始的耕作法：他们先把树木统统砍光，过一段时间干燥以后，在雨季到来之前放火焚毁，以草木灰作肥料，覆盖住贫瘠的雨林土壤。烧一次种一茬，其后要休耕1－3年，有的地方甚至要长达6年，等到草木长得比较茂盛之后再烧再种。当古典期文明繁盛、人口大大增加时，农业的压力也就随之越来越大了，于是玛雅人更多地毁林开荒，同时把休耕时间尽量缩短。这样一来，就导致了土壤肥力逐渐下降，玉米产量也随之越来越少。玛雅文明在人口大发展之后，面临着生态环境恶化、生活资源枯竭等严重问题，社会状况一落千丈。更为严重的是，在神权政治的体制下，玛雅王族和祭司将这种种“衰败之象”都归结为神灵的不满，所以他们更大规模地修建神庙，更频繁、更隆重地祭祀祈祷，期望能借神力扭转乾坤。当然，这样做的结果是浪费了更多的人力和已经贫乏殆尽的资源，直至陷入不可救药的恶性循环。随着农业生产供应的严重匮乏，玛雅古典时期高度发达的文明也开始崩溃。当城市周围贫瘠的荒地连成一片，饥饿就迫使玛雅人弃城而去了。经过百年衰败动荡之后，中央低地各城邦就都湮没在热带丛莽之中了。
4.太阳周期说
美国佛罗里达州大学地质学家戴维·霍德尔在最近的研究中发现，玛雅地区发生的旱灾具有明显的周期性，大旱灾每隔208年就会发生一次。因此，戴维·霍德尔提出了一个新的见解：玛雅文明的消失与太阳的周期性活动增强有关。霍德尔主持的这项研究，是从墨西哥南部的奇昌卡纳布湖湖底的沉积物开始的。他们在湖底钻孔，取得了1.9米的沉积岩岩芯样本，然后对样本中的碳酸钙浓度进行了研究。由于干旱年份湖水的蒸发量比较大，相对时期沉积物中碳酸钙的浓度也就比较高。碳酸钙浓度高的岩层，对应的年份就一定发生过旱灾。最后的研究结果是惊人的。沉积岩中的碳酸钙浓度，在年代上表现出了明显的周期性。每208年，湖底的沉积物中就有高浓碳酸钙层出现，换句话说，每隔208年，当地就会发生一次旱灾。最严重的一次发生在公元750年至850年，这正是玛雅文明消失的年代。而208年这个周期，与目前太阳活动每206年就有一次增强的周期正好吻合。很多专家也认为，这两个周期的吻合，绝不是偶然的巧合。霍德尔在地质学上的研究，为解决一个历史之谜带来了新的突破。一些学者还猜测，在三大印第安文明中，玛雅文明尤其以天文历法和宗教体系而著称于世，这可能也和旱灾的发生有关。或许早在1000多年前，玛雅人就已经发现，天体的运动和他们的生活息息相关，所以他们才会以一种古代印第安人中少见的热情和执着，来观察各类天体的运动。
5.等级划分说
有学者认为，严格的等级划分是导致后古典时期文明衰落之后，玛雅文明销声匿迹的最主要原因。玛雅高深的知识和文明只掌握在极少数贵族和祭司的手中，占玛雅人口绝大多数的下层劳动者完全是文盲。这些养尊处优的贵族知识分子，在繁华殆尽后难以生存，乃至很快消失，从而也带走了辉煌无比的玛雅文明。留下来只是那些普通玛雅农民，他们自然无法读懂那些本来就一无所知的文字和史书了。
6.内战说
玛雅文明消失的原因也可能是争夺财富及权势的血腥内战，因自相残杀而毁灭的。一些学者认为，玛雅人并不是传说中那样热爱和平的民族，恰恰相反，在公元300年至700年这个全盛期，毗邻城邦的玛雅贵族们一直在进行着恐怖的争权夺利的战争。玛雅人的战争仿佛一场恐怖的体育竞赛：战卒们用矛和棒作兵器，袭击其他城市，其目的是抓获俘虏，并把他们交给己方祭司，作为向神献祭的礼品。这种祭祀正是玛雅社会崇拜神灵的标志。玛雅社会一度相当繁荣，农业、手工业以及商业贸易都非常发达，但自公元7世纪中期开始，玛雅社会衰落了。战争无止无休，生灵涂炭，贸易中断，城毁乡灭，最后只有10%的人幸存下来。
7.太空移民说
在布兰科“铭文神殿”中，曾发现一个很奇怪的皇家坟墓。它中间停放着一具巨大的石棺，里面躺着一位玛雅国王的遗骨。目前一般认为他曾是布兰科一位极受尊敬的国王，名字叫太阳陛下帕卡尔。这个布兰科的石棺是用一块巨大的木兰花色石灰石制成的，大约有5吨重，面积超过7平方米。石棺上盖有一个雕刻很复杂，上面刻画的是一个蜷曲的几乎处于W形状的玛雅人形。周围环绕他的是一些奇怪的图案。位于中心的人物看起来像是浮在那里一样。瑞士作家艾瑞兹·温·达尼肯于20世纪60年代在他的名著《神之战车》里提到，在棺盖中心处蜷着身子的那个人实际是一个宇航员，他正在控制自己那艘正在起飞的飞船。有些人甚至因此推测玛雅人突然消失的原因是他们跟随外星人的宇宙飞船一同离去了。当然，这只是一种猜测。不过，玛雅人对天文如此了如指掌，他们创造了奇迹般的玛雅文明，然后又神秘地消失了，或许他们真是外星人与人类的后裔，被先进的另一个星球的“祖先”给接走了。
8.沉入大海说
据有关资料显示，在大西洋中曾有一个大西洲，它经济繁荣，文化发达，可是在10000多年前的某一天，它一夜之间沉入了大海，从此毁灭了。翻开地图就可以发现，大西洲的位置离犹卡坦半岛很近。德国科学家莫克认为，玛雅人在公元前8499年6月5日13时开始了他们的新纪元。在玛雅人中间流传着这样一句话：“世界由5个太阳主宰，一个太阳代表一个纪元”。如果以上材料真实可靠的话，那么，或许玛雅人会是幸存的大西洲人和美洲当地人的后代，他们深知祖先的毁灭，他们认为在公元后的某一天，又一个纪元将灭亡，所以集体向北迁移，并在之后的某一天，集体跳入大西洋，逃避世界的灭亡。当然，这一说法还有待论证。
9.内部暴乱说
据考古研究，在阿兹特克人到达陶帝华康城（Tonuhuacan）时，这座古城已经荒废了。考古学家认为大概是那里发生了推翻僧侣神权统治的暴动，其现存的神像统统被砍去脑袋，祭祀神庙也遭捣毁的事实，也暗示了这一点。据此，我们推测，或许玛雅文明消失原因也是如此。大量祭祀和压迫使得人民起来反抗，于是玛雅统治世界发生了大暴乱，从而导致了玛雅文明的灭亡。
10.祭祀杀人过多说
古玛雅人与阿兹特克人有许多相似之处。他们认为太阳将走向毁灭，他们认为自己的行为能延续太阳存在的时间，他们必须通过做一些自我牺牲来保留太阳的光芒四射，阻止它走向灭亡。他们这种认识导致了以人心和血来喂养太阳的做法。玛雅人以被用做祭祀为荣，奴隶主把奴隶的心脏挖出来献给太阳，于是为此死亡的人越来越多。据说，16世纪西班牙人曾在祭祀头颅架上发现过136000具头骨！当时，为了庆祝特偌提兰大金字塔的落成，在四天的祭祀中，奴隶主竟然杀死了36万人！我们认为，用于祭祀的人大多是族中身体健康的人。频繁的祭祀，使被杀的人越来越多。玛雅人大量减少，大概是造成玛雅文明消失的原因吧。
关于玛雅文明消失的原因，历来众说纷纭，大多数人倾向于相信当时玛雅人遭受地震、飓风的侵袭，加上人口爆炸、粮食不足、农民暴动和异族入侵（西班牙殖民者入侵）等多方面的原因，才造成了玛雅文明的衰亡。但是，确实的答案还没有出现，这个谜团的破解，目前不过刚刚开始。