在那次未遂政变之后，瑟曼将军开始提高战备等级：所有值班部队现在都穿着伪装迷彩服。强化了神枪手训练，要求每个人——个人或小组——都必须熟悉自己的武器装备。三类和四类演习也增加了，从事“沙蚤”训练演习中的连队每天都要看一下那27个选定的目标（尽管有关部队对此并不知情）。为了提高使用夜视镜的熟练程度，每晚都要进行直升机攻击训练。
为了加强指挥和控制，瑟曼将军正式让斯廷纳负责作战及策划；10月10日，斯廷纳被任命为联合特遣部队南方司令部司令。
斯廷纳和他的参谋们对“蓝勺行动”计划的修改已占先机。9月初，威尔·卢斯马少将和计划制定人员与南方司令部的参谋碰头，对计划作进一步的整合。10月9日，斯廷纳和他的主要参谋飞往巴拿马，和南方司令部司令一起参加关于应急计划的高层会议——还是穿着便服，坐着没有标记的飞机。在随后的3天里，就在夸里高地南方司令部的指挥所里，这2批参谋敲定了有关作战及战术的细节问题。
与此同时，斯廷纳也抽出时间对那些可能的目标进行秘密的直升机侦察，因为这对计划的最终确定十分关键。陪同他的是对巴拿马以及巴拿马国防军位置十分熟悉的第193步兵旅旅长迈克·斯内尔上校。
会议结束时，瑟曼将军宣布斯廷纳将成为巴拿马所有作战部队，包括特种作战部队的总指挥官。他还宣布南方特种部队应急计划应包括以下目标：保护美国人的生命安全以及主要的地点和设施；抓获诺列加并将其交给主管当局；消灭巴拿马国防军；支持在巴拿马建立一个美国承认的政府；根据正式选举产生的政府的要求重建巴拿马国防军。
华盛顿还有一个没有明说、但又十分重要的任务，那就是营救被诺列加逮捕并关押在防卫森严的莫得罗监狱的中情局特工库尔特·谬斯。库尔特被告知，如果美国部队发动对巴拿马的进攻，他将被处死。负责处决他的人把他置于严密监视之下。
为了实现这些目标，南方特种作战部队对那27个主要目标要末实行保护，要末就予以摧毁。多数目标都在巴拿马城城内或周围，但有几个，包括里奥阿托的精英连、西马伦堡的第2000营以及距离首都数英里的托里霍斯-托卡曼机场（这是一个两用机场：托卡曼是民用的，而托里霍斯是军用的）。在靠近加勒比海的一侧，距离巴拿马城约40英里的科隆地区也有一些主要目标。
既然目标已经确定并列出了先后次序，斯廷纳和他的指挥官们就必须决定，对各个目标应采用的战术以及应选派的最合适的部队。
3天后，斯廷纳总结了他此次行动的“指挥官作战意图”。
他的主要意思是：“利用电子战能力，干扰巴拿马国防军的通讯，利用我们的EC-C130飞机（“空中独唱”式和“罗盘呼叫”式）压制民用电台，向巴拿马人民播送我们的信息，利用夜幕的掩护，突然同时对27个目标提供保护或发动攻击。此次行动的一个非常重要的部分是，从进攻开始时起到局势稳定时止，都要保护美国公民的人身安全。成功的关键就是突然同时摧毁巴拿马国防军、其指挥控制能力以及国家警察。主要战斗必须在天亮前结束，届时我们的部队将控制从巴拿马城到北部科隆，以及从西南部的里奥阿托到东北部的西马伦堡这一片地区。大多数巴拿马人是我们的朋友，因此我们必须将伤亡人数以及附带损伤减至最小。我们将使用战术部队发动心理战，劝说各个军事设施里的人不要抵抗，向我们投降。如果不起作用，就动用大批部队来完成这个任务。由于天亮后，那儿的秩序将会一片混乱，因此战术部队必须准备好执行维持治安的任务，保护人民的生命和财产安全。为达到这一要求，我们将在行动后开始4至24小时之内把第7步兵师和第16宪兵旅的其余部队调过来。抓捕诺列加，从莫得罗监狱营救库尔特·谬斯，以及其他特殊任务将由特种部队担任。这些任务是此次行动成功的一个不可分割的部分，将与其他任务一起在攻击开始时同时展开。我希望我们在攻击开始时发出的信号，能让我们在撒开队伍开始清剿巴拿马国内其他地方的国防军残余部队的任务时会更容易一点。如果我们能出其不意，且方法得当，我想巴拿马国防军是撑不了多久的。”
同时，斯廷纳也表明了他的战争哲学：“先发制人；出其不意；以强大的战斗力压倒敌人；利用夜幕掩护，在最初的以及后续的攻击中，最大限度地利用我们的夜战能力，把我们的优势兵力用在刀刃上；总是在对我方有利的条件下作战。”
这一行人于10月11日回到布拉格堡来完成这个计划的制定。
在随后的1个星期里，他们夜以继日地工作。出于安全原因，关于勒克将军的特种作战任务的计划继续在其总部进行，但第18空降军和特种部队的联络官会相互交换信息，以确保整个计划的连贯性和一致性。
他们回来后第二天早上，斯廷纳对布拉格堡的计划制定人员训话：
“我在分析这个计划时，下列这些既定的以及暗含的任务需要我们注意：
● 首要任务是保护在巴拿马的美国人的人身安全以及主要地点和设施的安全。
● 我们必须抓获诺列加并将其送交有能力的当局。
● 我们必须消灭巴拿马国防军，摧毁其指挥控制机构（也就是国防军总部）以及国家警察。
● 我们必须协助建立一个美国承认的政府。
● 我们必须准备战斗一结束就执行维持治安的任务——因为那时的秩序将一片混乱。
● 我们必须准备执行必要的建国任务，帮助新政府站稳脚跟，不辜负人民的期望。
● 我们必须准备根据新政府的要求重建巴拿马国防军和国家警察。
“这是一个非常复杂而又艰巨的任务，”他继续说道，“我们必须在一夜之间击败巴拿马国防军和国家警察，可是第二天，我们又要使我们的作战对象以崭新的形象出现——不再是压迫人民的人，而是受到人民爱戴的人。我们还将触及巴拿马国防军，使他们以平民或国家警察的新面貌出现——由新政府决定。
“几乎所有的战斗都必须在城区——市区或居民区——进行。我们必须严格控制附带损伤——把双方的伤亡人数减到最低限度——并且严格限制在执行任务过程中完全可以避免的伤亡。
“因此，我们必须给自己制定一些可能会限制我们整体作战能力的作战规则。也就是说，我们必须有所限制，只能使用火力适中的武器——单兵步枪、机枪、66毫米轻型反坦克武器和AT-4型反坦克武器、配有大口径主炮的谢里登装甲侦察车、配有‘地狱火’导弹的阿帕奇直升机、AC-130武装直升机和大炮——最后3项只有在摧毁建筑物时才能作为直接火力使用。不能使用诸如迫击炮和炸弹之类的‘区域火力’武器。
“这些作战规则必须非常明确，以便参加此次行动的每个人都清楚地知道什么能做，什么不能做。
“至于这个计划的制定，参谋人员将侧重于此次行动的常规作战部分，把特种作战部分——尤其是抓捕诺列加和他的追随者的部分——留给勒克将军的总部完成。为了给文官政府创造一个能够在其中执政而又不受威胁的环境，就必须消灭诺列加这帮人。其他特种作战任务也将由勒克指挥，但在具体执行时，这两个部分是统一的。勒克将指挥特种作战，向我负责，其他特遣队指挥官也是如此。
“此次任务成功与否，在很大程度上取决于承担各项任务的小分队的战斗力。因此，我将给他们以最大的权限和自由度，以随机应变，完成任务。”
他继续说道，“我本人将负责安排这次行动的指挥与控制。这将比较简化、比较直接——没有不必要的中间环节。正如现在这样，我打算把美国陆军南方总部并入我的总部（南方特种部队），让马克·西斯内罗斯当我的副手。
“由于涉及到不同军种的不同部队，我们必须有一个联合的指挥通信与电子操作指令，这样我们就能相互联系。这个指令必须简明扼要，它不是西尔斯或罗巴克公司的商品目录。一旦把它搞出来，我就打算进行一次演练，把我们所有的无线电和其他通讯设备都打开，进行相互联系——从行动开始直到结束，我们所使用的频率和呼号都不变。我们执行此次任务就要有这样的势头，即使巴拿马国防军得到一本指挥通信与电子操作指令也不要紧，因为反正他们也拿我们没有办法。
“最后，我希望4天内能见到计划草案，并且在5天内能送到我的主要下属指挥官手中，使他们能有时间仔细研究一下，然后来参加在巴拿马的下一次会，我准备让他们都参加。”