渡江战役结束后，国民党军江防部队除被歼者和逃到台湾者外，其余大部逃往福建及舟山群岛等沿海岛屿，其中逃至福建的有第6兵团李延年兵团残部，第8兵团刘汝明部第55、第68、第96军残部，第17兵团侯镜如部第106军残部，第7绥靖区张世希部第20、第88军残部，第9编练司令部张雪中部第73、第74、第85军残部；逃至舟山群岛的有第45、第21、第75军残部及暂编第1军残部。
蒋介石仍企图依靠这些残部和原在福建的第22兵团、原在浙东地区的第87军等部，重新组织防御，以便控制东南沿海地带及近海岛屿，屏障台湾，待机反攻。
在东南沿海地带，漳厦金的战略位置极其重要。漳州是福建沿海的重要城市；厦门是个重要港口，与金门岛并列，拱卫着闽南大陆，历来为兵家必争之地。
厦、金两岛的战略地位，国民党在喉舌《中央日报》说得很清楚：“金厦的得失，对台湾国军进守之势，均有莫大的影响，本省（指台湾）应该尽一切的力量，来支援金厦战役，以保全这一个重要的反攻基地。”
因此，早在福州战役之前，蒋介石就在7月22日亲自到厦门，部署加强漳、厦、金地区的防务。福州战役之后，国民党军又采取一系列措施固守漳、厦、金地区。
一是调整指挥机构，撤换头目。撤销福州绥署6兵团，由汤恩伯任福建省主席和东南军政长官公署长官，统一指挥刘汝明第8、胡琏第12和李良荣第22兵团；
二是改编残部和调整兵力部署。令原6兵团残部约8000人守平潭岛。将22兵团所属部队整编成第5军（下辖200、166师）、第25军（下辖40、45师）。除166师留在厦门岛外，其余3个师及台湾调来的201师驻守大小金门岛。将第8兵团的55军从漳州调驻厦门，该兵团68军、原6兵团96军残部及独立37师、福建省保安纵队的4个团，防守漳州同安地区。将12兵团所属部队整编成76军、18军和19军，从闽西南及闽粤边境退守广东潮汕地区，作为漳厦地区的预备队。除平潭和潮汕地区外，漳州、厦门、金门地区的国民党军共有2个兵团5个军12个师的番号，总兵力6.5万余人；
三是加修防御工事和阵地。国民党特意拨给银元1万元，金元券120亿元，加紧扩建厦门、金门要塞工事，还派高级参谋技师，精心勘察、设计和施工；
四是加强海空军力量，力图形成立体防御。空军直接由台湾派出部分作战飞机利用高崎、金门机场，侵入内陆袭扰。海军派来“太湖”、“大昭”、“南安”号等10多艘大小炮艇，穿梭游弋，封锁海面。