阿济格的案子揭开了清算多尔衮的序幕。
接下来就是大清洗了，我们很难想象这样成熟的政治手笔是出自十三岁的福临手中。对于孝庄这个女人，我们实在应该刮目相看。
说实话，听到多尔衮的死讯，孝庄是根本没有时间为多尔衮哀悼的，当前最要紧的是如何应对这种剧变，如何让帝国稳固。帝国的未来是非常不清晰的，朝中大臣多是多尔衮的亲信，王公大臣们很多是变色龙，你不知道他们会倒向哪边。
此时，孝庄最需要的是一个能够帮助自己的人，这个人必须对大清忠心耿耿，而且是个谋略高手。应该找谁帮忙呢？孝庄想到了德高望重的范文程。皇太极在世的时候，经常召范文程进宫议事，所以孝庄也经常看到范文程，对于这个大清国的栋梁之臣，孝庄以师礼相待。
多尔衮逝世后，政局不明朗，孝庄不方便用太后的身份召见朝廷重臣。每到这时候，总少不了一个人的身影，苏麻喇姑。
苏麻喇姑见到范文程后，警惕的范文程就低声说：“小心隔墙有耳。”两人找到了一个隐蔽的地方，范文程才感慨地说：“太后的处境老朽了然于胸，你不必赘言，时间紧迫。我只想知道，太后是否一切以大清江山为重，没有其他的想法？”
苏麻喇姑忙不迭地点头。
范文程终于郑重地说道：“摄政王虽然对我们大清有很大的功勋，但是位极人臣，形式上跟皇帝没什么区别，这是对朝廷的蔑视啊！即使摄政王自己没有想法，但是一帮宵小在他耳边蛊惑，导致悖逆的态势越来越明显，摄政王不忠之举越来越多。也是上苍保佑我大清，居然让摄政王猝死关外。不过，形势仍然不容乐观，两白旗和正蓝旗的王公大臣仗着武力，气焰嚣张；现在武英郡王准备浑水摸鱼，形势那是非常危险的。在这种情况下，必须出现一个有手段有魄力的人，以雷霆万钧之势，将危险势力斩草除根。除此之外，我觉得没有什么更好的办法。”
苏麻喇姑的记忆力是非常好的，范文程的话她牢记在心，一字不漏地复述给孝庄太后听。
孝庄听完后，一言不发，良久才说道：“霹雳手段我可以做得到，也必须去做；菩萨心肠，纵然我心怀此念，也未必能做得圆满。”
顺治八年（1651）二月十五日，有人控告多尔衮谋反，尽管这时多尔衮已经死了。控告者是谁呢？苏克萨哈，正白旗的议政大臣，以前是多尔衮的亲信。他控告多尔衮什么呢？
苏克萨哈说多尔衮死在行猎之地，侍女吴尔库尼要殉葬。人之将死其言也善，有时候不是这样的，有时候是人之将死其言也恶，这侍女本来活得好好的，现在要跟多尔衮陪葬，是人都不爽。你让我陪葬，我就告你谋反，我们现在没法知道吴尔库尼的心思。
吴尔库尼是一个非常特别的人，如果没有她告多尔衮谋反的事，估计这女人就不会在史书中出现。在电视剧《孝庄秘史》中，吴尔库尼所以揭发多尔衮是因为多尔衮拆散了她和自己心爱的人。真实情况怎样，我们并不知道，但可以肯定的是多尔衮非常喜欢这个侍女，虽然这个侍女身份低微，但多尔衮指定让她殉葬，那意思是死后都让你陪。
吴尔库尼为什么揭发多尔衮，一直是个谜。她这个揭发对自己是没有好处的，揭发完了之后还是该怎样怎样，自杀殉葬了。当然，也有人认为她是被灭口的，不是自杀。具体怎样，我们现在已经搞不清楚了。
多尔衮死后，吴尔库尼找来罗什、博尔辉、苏拜、詹岱、穆济伦五个人，告诉他们：“在摄政王王府里有八补黄袍、大东珠、素珠、黑狐褂，王爷没有让其他人知道，你们可以把这些东西偷偷放进王爷的棺木中。”
如果说吴尔库尼是为了求生的话，她这个做法是可以理解的，但事实上她也自杀殉葬了。将黄袍这些东西作为陪葬品，简直就是谋反的证据。当然了，这事情很有可能是栽赃，压根就不关吴尔库尼什么事。
这事发生后，告发多尔衮的人越来越多，俨然变成一股潮流。墙倒众人推一定是没错的，墙没倒去推是有风险的。
不久，有人告发多尔衮在永平府一带圈房，准备把两白旗的人马搬到那儿。顺治帝接到举报后，自然是让大臣们认真调查。接着，又有人举报说何洛会曾经依附多尔衮，辱骂豪格的儿子，顺治说好好调查。
调查的过程应该说是非常有效率的，结果是告发的事情都是真实，多尔衮私制黄袍、率两旗驻扎永平、阴谋叛逆，这些罪行都是确凿的。判决很快就下来了，多尔衮的家产和人口被没收，养子多尔博和养女东莪送给亲王多尼。何洛会被抄家，凌迟处死。苏拜没有举报多尔衮棺材内的违禁品，本来也应该处死，但顺治帝格外开恩，免死。
如果认为对多尔衮的清算到此结束，那我们就太小看了孝庄。
二月二十一日，济尔哈朗、满达海、博洛和尼堪四位亲王联合大臣们联名上奏，要追论睿亲王多尔衮的罪状。所谓追论就是以前讨论的还不全面，现在必须综合更多材料，更加详细地讨论这个人的罪状。多尔衮的罪状那是相当地多，我们不妨列举一些主要的。
一、以皇上之继位尽为己功；
二、擅权独断，作威作福，任意罢免选拔人才，一切公文自己裁断，僭称圣旨；
三、不让济尔哈朗摄政，擅自让自己的弟弟多铎当上辅政王；
四、整死肃亲王豪格，逼纳其妃；
五、以朝廷自居，令诸王、贝勒、贝子公侯等每天都到自己的府上上班；
六、排场跟皇帝一样，浪费国家资源；
七、亲到皇宫内院；
八、诳称太宗皇太极之即位“原系夺立”；
九、逼取皇上侍臣归到自己的旗下；
十、私制帝服，藏匿御用珠宝；
十一、欲带两旗移至永平。
……
顺治拿到罪状一看，心想，这些大臣真是好样的，看到这张罪状，大家都觉得多尔衮人神共愤。如果宽恕的话，实在是天理难容。但多尔衮已经死了，家产也被没收了，还能怎么处罚他呢？
办法总是人想出来的。首先是剥夺多尔衮的爵位和名誉，顺治帝下诏：“谨告天地、太庙、社稷，将伊（多尔衮）母子并妻所得封典，悉行追夺。”从多尔衮死后被追尊为成宗皇帝，到剥夺庙享剥夺一切仅仅两个月的时间，政治这东西说变就变，从中可以看见人性之丑陋。可以这样说，政治放大了人性的丑陋。
当然，这还没有结束，西洋传教士卫匡国记载，顺治帝对多尔衮跟自己母亲的暧昧事非常痛恨，加上一直看不惯多尔衮，顺治帝下令鞭尸。将多尔衮的尸体从坟墓里挖出来，用棍子打，用鞭子抽，最后枭首示众。鞭尸这种行为如果没有刻骨的恨是做不出来的，但究竟是顺治想鞭尸，还是孝庄想鞭尸，抑或是两人都想鞭尸，这个就说不清楚了。
老外看到鞭尸这种行为，除了佩服中国人的创意之外，对中国人人性中的那种恨也是非常佩服的。
在清算多尔衮的同时，顺治也在积极为长兄豪格平反。二月，顺治帝封豪格的儿子富寿为和硕显亲王，将豪格的功劳重新记录在赏功册上，并且归还豪格的财产。
令人吃惊的是，清算多尔衮的过程中，大学士刚林也受到了处分。根据谈迁的说法，多尔衮死前和阿济格密谋，正是刚林识破了阴谋，连夜赶到京城，才将政变扼杀在摇篮里。在多尔衮死后，刚林的功劳是非常大的。他不仅告密，提前扑灭了一场政变，还帮助皇上从多尔衮的府中收回信符和赏功册。即便功劳如此大，由于刚林多年追随多尔衮，济尔哈朗认为这个人不可信，始终是一个祸患，所以选择了杀人灭口。刚林被处死后，家产被没收，妻子为奴。
还有一个大学士祁充格，因为以前跟着多尔衮混，擅自修改《太祖实录》，参与多尔衮的谋反，最后也被判了死刑。清算运动很快就扩大化了，汉人大臣范文程、宁完我、王文奎等人也被人告发，曾经和多尔衮狼狈为奸，但是顺治皇帝并没有给他们治罪，其中原因我们也不得而知，应该有一些潜规则在里面。当然，跟顺治帝深受汉文化有关系，跟幕后人物孝庄的态度也有关系。
四月份，又惩处了大臣巴哈纳，罪名是谄媚睿王，将户部金银送到多尔衮家中。巴哈纳也是爱新觉罗家族的，历任户部尚书和刑部尚书，是个位高权重的人。巴哈纳被给予革职处分，家产被没收了三分之二。
冷僧机也被处分了，冷僧机以前是满洲正黄旗人，跟着三贝勒莽古尔泰混。皇太极打掉莽古尔泰时，冷僧机非常识趣，自首保命，此后就跟着皇太极混。多尔衮掌权后，冷僧机又跟着多尔衮混，而且还得到多尔衮的宠信。冷僧机的罪名是为多尔衮说话，污蔑两黄旗大臣，到处强调当年立顺治的是多尔衮。冷僧机为了讨好多尔衮，还把珍贵的白狼裘献给多尔衮，没想过这么好的东西应该献给皇上。大家商议之后，决定把冷僧机处死。不过顺治帝却饶他一死，批道：“姑从宽免死为民。”
八月，吏部尚书谭泰被人告发，罗列罪状十多条，其中最严重的一条是，谭泰曾经在多尔衮府上表示“我死亦在此门，我生亦在此门”。议政王大臣商量之后，认为谭泰和子孙都应该问斩。顺治网开一面：谭泰就地正法，籍没家产，子孙免死。
冷僧机逃过第一劫，却没有逃过第二劫，也许是做错了什么事。顺治九年（1652年）三月，顺治皇帝突然颁布了一道谕旨：“拜音图、巩阿岱、锡翰、席那布库、冷僧机这五个人曾经依附多尔衮，朕心知肚明，之所以从轻发落是希望他们幡然悔悟，没想到这些人死不悔改，还敢藐视朕，扰乱国政，朕实在是不能再原谅他们了。”
议政王大臣们又开始搜罗这些人的罪状，这些大臣们当然是希望从严发落，而顺治一定是从宽发落，以此彰显君王仁慈，皇恩浩荡。
顺治说，拜音图这个人庸弱无能，到了晚年，更是昏聩，看在他年老体迈的份上，就免他一死，关在牢里吃套餐。巩阿岱、锡翰、席那布库、冷僧机这些人呢，死不悔改的东西，全部就地正法，没收家产。
本来这五人的家人也应该一并处死的，但皇恩总是浩荡的，不必要的死伤是皇帝不愿意看到的，所以你们都不必死，老老实实做老百姓吧！
经过一年多的清洗和淘汰，多尔衮的党羽总算剔除得差不多。如果说这次清算有什么特色的话，就是只在高层内进行，没有扩大到下层官员，更没有扩大到平民百姓。这个做法是非常明智的，没有引起国家的动荡。
多尔衮一世戎马，为大清帝国立下了汗马功劳，却遭到这种待遇估计是他始料未及的。直到一百多年后，出现了一个喜欢下江南，喜欢到处享乐的乾隆，才给他平了反。乾隆是个享乐主义者，心里没那么多怨恨，觉得这人对我们大清有功，不该是这么个待遇，应该给他平反。看来，有时候做好事只需要平常心。
当然，我们也不能说孝庄和顺治这么做就做坏了。当时，国家不稳，皇帝又很小，满朝多尔衮的爪牙。小皇帝要树立威信，加强皇权，除此之外别无他法。再说，多尔衮本来就视自己眼中钉肉中刺，顺治不拿他开刀拿谁开刀，何况还是个死人，毫无还手之力。