伪“自治委员会”成立以后，配合日军搜捕中国军人成了他们主要的工作。千千万万中国军民惨死在屠刀之下以后，日军仍然不肯罢休，为了进一步搜出所谓“隐藏在难民区的两万名中国军人”，日本军方又策划了一个良民登记的阴谋。
12月22日，南京大街小巷到处贴满了日本宪兵司令部对于良民登记的通告：
为布告事：
自12月24日起，宪兵司令部将签发平民护照，以利居留工作。凡各平民均须向日军办事处亲自报到，领取护照，不得代为领取。倘有老弱病人，须家属伴往报到。无护照者一概不得居留城内，切切此令。
依据日军要求，凡16岁以上的男女都必须登记领取安居证，不得代领，如此人人过关，隐藏在民间的军人，自然也就难以逃脱了。
领取安居证的地点分设在各个难民区，新街口广场一个，山西路口广场一个，金陵大学操场上也有一个。24日清早，金陵大学操场上已经排起了长长的队伍，台上坐着几个日本军官，查问委员角下讲话了，他会讲中国话：“你们凡是当过中国兵的，统统的站出来，皇军宽大的，保证你们的生命安全，有工可以做，还有饭吃。要是隐藏不自首的，查出来统统的要杀头的！”
说着，他杀气腾腾地做了个砍头的姿势。
没有人站出来，也没有人做声，人们眼光里流露着明显的不信任。于是一个戴眼镜的汉奸站到了台前，他声嘶力竭地叫喊着：“同胞们！你们有谁当过兵的要赶快站出来！凡是自首的，皇军统统宽大处理！”看看还没有反应，他又拍着胸脯信誓旦旦地保证：“同胞们！我以中国人的身份保证你们的生命安全！难道你们还不相信自己的同胞？！”
他拍着胸脯连连地保证着。于是有人轻信上当了，1个、2个、10个……操场上站出来一两百人。站出来的同胞都被装上汽车拉走了。不久传来消息，这些人都被拉到司法部大院，被捆绑在十字架上，被日本士兵们的刺刀统统“处理”掉了。
于是，奴才走狗詹荣光又摇着尾巴跟角下太君去演戏、邀宠，欺骗别的同胞。
剩余的人经过这一番折腾以后才开始登记，登记者首先由汉奸盘问一番，接着再由日军检查你的身上有没有当兵的痕迹，最后才登记发给你证明，证明上大意是如此写着的：
姓名，性别，年龄，体格颜貌特征（登记时在此项内画一登记者之单线面形），认右者并无危害帝国部队之意。
昭和 年 月 日（中岛部队之印）
在拿到这张安居证之后，登记者才能稍稍松一口气。然而，在拿这张证的层层关卡之中，打铁的，拉车的，挑担的等等，凡身上可能留有类似当兵痕印的人，以及在盘问时胆怯害怕的，回答不当的人，又有多少成了法西斯强盗们刀下的冤魂！
过了两天，日本鬼子觉得如此的登记清查效果还不理想，于是又更换了新的花样：男女必须分开站好，排成两队分别登记。
女人们的登记尽管没有被认定为中国军人的危险，但又有女人的麻烦和灾难。日本人首先是嬉皮笑脸地在女人身上先摸一遍，直弄得妇女们一个个脸红耳赤还不肯罢休。接着拣年轻漂亮的统统留下，先慰劳皇军以后才能领到安居证。天性爱美的女人们，在前往登记的时候，吓得一个个都穿上褴褛的衣服，搽上锅底的烟灰，但许多人依然逃脱不了厄运。有一回，一个日军刚把手伸进女人的裤裆里，便吓得大叫一声触电般把手缩了回来。原来这个聪慧的女人为了保护自己，在肚下和大腿两侧都贴上了烂糊糊的膏药，日本人以为她患有传染病，吓得大声叫喊着把手缩了回来。这件事马上传开了，许多女人便效法学习，但日子一久，这个方法也渐渐失灵了。
男人们的登记危险性就更大了，日本人首先叫家属们前来认领，凡是没有家属认领的，肯定是中国兵无疑，统统用车装走全部屠杀。这个办法尽管凶狠、毒辣，但许多中国军人仍然逃脱了敌人的搜查。其一是南京沦陷之初，日军的奸淫暴行使南京市民大为惊恐，许多家长为了女儿的安全和未来，以最快的速度和最简便的方式，把女儿婚配了人家。而许多隐藏下来的官兵，为了寻求保护，也需要有一个家，于是许多流散民间的官兵，一夜之间成了南京人民的夫婿和儿郎；其二是出于爱国情感，在日军搜捕中国军人的时候，许多南京老妇人便出来认儿子。有一次在金陵女子大学登记的时候，18岁的中国士兵喻志清被日本人从队伍中拖了出来，眼看就要被拖去枪毙了，和他在难民区住一起的一个胖老妈妈一看不好，立刻扑了过去，一边哭喊着：“儿啊！我的乖乖儿啊！”日本人一下子搞懵了。胖妈妈立即又强装着笑脸向日本人说：“太君！他是我的儿子！”喻志清就如此得救了，他从此就有了一个南京的好妈妈。刘秀英去登记时年纪并不大，但她穿着黑色的棉衣棉裤，梳着巴巴头，涂着锅烟灰，看去很像一个老婆婆。当一群被日本兵押着的人从她身边走过的时候，一个穿蓝色中式服装的瘦个子年轻人小声对她说：“大妈，你做好事救救我，日本人要拉我去枪毙了！”刘秀英心中也很害怕，但出于爱国热情，救人心切，也就麻着胆子挤出去，对一个翻译说：“这是我儿子啊！”翻译对日本人一说，那个年轻人也就得救了。还有一次登记的时候，操场上密密麻麻站满了被抓住要送去枪毙的人，国际委员会的工作人员着急了，便发动难民区的老太太们前去认人，几十个老太太哭的哭，喊的喊，挤到操场上，有的喊儿子，有的认孙子，一下子救出了几十个人。
尽管这样，日本人进行良民登记，发放安居证的阴谋，仍然使许多中国军人和百姓没能逃脱厄运，仅难民区里，被搜捕抓去屠杀的就有成千上万的人。
良民登记结束的一天，南京上空飞来一架日本飞机，在空中转了几圈，漫天传单雪片似的撒了下来，传单上面是一幅伪善的宣传图画：一个日本兵抱着一个中国儿童，儿童手上拿着吃的东西，旁边跪着一个中国妇女。传单上还印着一句自欺欺人的鬼话：“信赖皇军，就可得救。”
然而，南京人民都已经亲眼看到了，日本军人是怎样用刺刀和机枪“拯救”中国人的。在数十万南京同胞惨遭杀害，在血河尸山绵延江岸数十里的时候，日本军方撒下的这些欺骗传单，实际上成了对法西斯军国主义暴行绝妙的嘲讽！
惨剧仍在继续，屠杀依旧进行，谎言飘散之后，活在地狱中的南京人民，还是生活在血雨腥风的恐怖之中。