李自成仓皇撤离北京城以后，京城内外，社会秩序在经过两次换主之后已经相当混乱，人们对后入主北京的满洲贵族怀有严重的恐惧心理。更为严重的问题是，之前李自成农民军大量占用粮草，撤离时又将京城中的粮草运走，造成百姓生活极其困难的局面。形势严峻，刻不容缓，稳定北京，站稳脚跟，对清朝未来的发展，以及能否实现全国统一，关系重大。还没有决定迁都时，摄政王多尔衮就果断采取了措施，实施新政策，力图扭转混乱的局面。
在经过深思熟虑并和诸贝勒大臣商讨后，他拟定了一套方案，针对现状彻底改变了往日的一些策略，把重点放在赢得民心上。他认为，虽然得了京城，如果没有得民心，这和守着一块空地没什么区别，相反还有可能滋生民众起义的苗头。按照现在的形式来看，政策需一步一步来实施，这样会避免不少问题。顺治七年十二月，摄政王多尔衮病逝。顺治八年正月，顺治刚刚十四岁，正式亲政。他继续多尔衮摄政时期的各项政策，继续严整吏治，严惩贪污行贿等犯罪者，力图建立一代廉明政治。
顺治帝和先前的清帝不同的是，他是在安定的环境中成长起来的皇帝，虽然没有先帝般骁勇善战，但在理论学识上更加博学。多尔衮在政期间所做的事，他早就看在眼里，在严惩贪官上，多尔衮虽然屡次尝试改善，却没有得到实质性的效果。顺治认为，问题恰恰出在时间和力度上，以当时的背景而言，多尔衮能够做到这一点已经实属不易。而现在自己亲政正好可以抓住这一点，一来可以证实自己的实力，二来则可以让国家更为安定。他把这点作为亲政后首先要解决的问题，经过一番深思熟虑后，他认为，如果想杜绝贪污受贿之风，必须从各个角度，下大力气去解决。
他开始不断发出指示，在各省设总督、巡抚、都御史、巡方、巡盐、巡视茶马等御史，以作监督。他对各御史说道：“我封你们这样的官，并不是要让你们贪图富贵，而是让你们安民，贪官祸害的是国家和人民，最为可恨，你们一定要把贪官一个个全给我揪出来！”但是到了顺治十二年，“贪风”依然不息。于是顺治加大了力度，制定了更为严厉的法律，同贪官污吏进行斗争。同年十一月，他宣布：从今以后，内外大小官员，凡收赃十两白银以上者，除了依律定罪外，不分什么枉法不枉法，其家产全部充入国库。如此一再增加力度，似乎并没有在实质上起到什么效果。终于，顺治想到了一个想法，大案、要案，自己都要亲自审讯并处理，这样一来，可以震慑贪官。
顺治十二年，发生了顺天巡按顾仁受贿案，是最为引起震动的一件大案。这是一件血淋淋的案件，告发者是吏部书吏章冕。十月十九日，章冕屡次揭发顾仁不成，于是下了狠心自尽，用死来告发顾仁贪赃枉法，陷害无辜。顺治闻讯很是震怒，顾仁本是自己钦点的钦差，以刑部主事任巡按衔。让顾仁查访地方百姓的疾苦，并且主抓贪污受贿者，临行前顺治一再叮嘱。然而顾仁一出城就揭去了脸上清廉的假面，胆大妄为，开始以权卖权。
王琦、章冕等人，欲谋取巡按书办的职位，便托了顾仁的熟人刑部司官贺绳烈为其求情，并各自送了二百两银子作为好处费给顾仁。但官位只有一个，狼多肉少。王琦暗中又送给了顾仁二百两银子，顾仁便接受了王琦，其余人全都白花了银子，被堵在门外。章冕送了“无头银”没得到想要的，那二百两本是家里的全部家当，这样一弄，自己就连家也没了。章冕心中按捺不住，那份刚开始的谄媚也一并随着银子给扔掉了，他开始想办法揭发顾仁的行为。自古官官相护，他刚一揭发，这边就把事情转给了顾仁。顾仁刚开始并不理会，因为先前也曾出现过类似的情况。有他们这些官压着，揭发的人往往在揭发的过程中自己就退出去了。但是章冕不同，他是个性情中人，心想：我就是死，也要揭发顾仁的丑行。于是，他扬言道：“你这是贪赃枉法，我虽然也有错，但我会以死抵罪，足够偿还我先前犯下的罪。但是你却不同，我要揭发你，以少一些人陷入你的利诱。”
顾仁怕事情闹大了对自己不利，便起了杀人灭口之心，等派了杀手过去以后，却发现章冕早已经在家中自刎而死了。章冕的事情闹得满城风雨，街头巷尾，闲着的、忙着的、说书的，几乎没人不提。直到这件事传到了宫里，传到了顺治的耳朵里。
顺治大怒，同时心里也有些自责，自己看走了眼，让这么一个贪官去惩治贪官，只会让官一个个变得更贪。思虑在三，他决定亲自主抓这个案子。
经过核实，顺治了解了其中的缘由，便召集满汉文武大小官员，把顾仁押到了大殿之上。众官早就猜到了顺治的用意，其中和顾仁有些牵连的官员开始有些担心后怕起来。
顺治在大殿上来回走了几步，双手背在后面，沉默不语。这种沉默让众官感到心里寒寒的。终于，他在沉默了好一会儿后说道：“朕不知如何开口，今日召集众官来殿其实没别的事……”说着，他用手指着跪在地下，浑身如筛糠般抖个不停的顾仁说道：“是想问问朕亲自御点的钦差功绩如何，顾爱卿能粗略地报一报么？”
顾仁埋头跪在地上，颤声说道：“臣有罪，罪不可恕，还望皇上开恩，念在我也曾为大清立过不少功绩，饶臣一死。”
众官同时发出一阵嘘声，心想：你这罪就算再长十个脑袋都不够砍的，还是祈祷自己能死个痛快，并且少牵连点人吧。
顺治脸上刚开始还是温和的询问之色，顾仁的话刚一说完，他的脸色顿时变得深沉了，语气也铿锵有力起来：“顾仁，朕正是看你曾立过不少功绩，才委重任于你。但是你给朕带来了什么？给我大清带来了什么？是灾难！”说着，他把脸面向众官说道：“顾仁背旨违法，贪污受贿，给我大清带来了严重的负面影响。朕自当惭愧，没有看清。顾仁，朕本该判你凌迟处死，念你也曾为我大清做出功绩，现在改判你立即斩首，妻子、子女、家产全部充公。”
顺治召集群臣的本意，其实还有另一个警示的目的，以顾仁的下场来警示即将或者正在贪污的官员尽快收手，顾仁的下场就是违令者的下场。众官哪有不明白的道理，纷纷跪在地上叩首齐喊道：“皇上英明，大清万代。”
几日后，顺治追究是哪个人举荐顾仁，科举何人录取，并且是怎么混入朝廷为官的。经过内大臣鳌拜确查，顾仁的推荐人是刑部尚书与刑部侍郎王尔禄，录取顾仁考选者是吏部尚书王永吉等五人，顺治分别给予他们降级处分。
其后，顺治亲自经手处理了好几个大案。
顺治十五年十一月，江南按察使卢慎言贪赃数万两银子，数额巨大。顺治核实后，将卢慎言凌迟处死。
类似的大小案件有很多。自顺治八年到十七年，九年中，顺治亲自处理的贪污案件达四十五件。可以肯定，对贪污受贿的从严惩治，是对腐败势力的沉重打击。除了不断加大打击贪污腐败的力度，同时还不忘及时提拔重用贤德的人。清除贪官污吏，淘汰一些庸官，选用优胜有贤的委予重任。顺治把发现和选拔人才看做吏治的一个极为重要的方面，从一定意义上来说，这是“澄清吏治”的根本保证。顺治把惩贪和用贤结合起来，两者相辅相成，在其后的时间里确实有了实质性的改善。
从政治体制上来说，清朝的政治体制沿用了明朝的政治体制。在体制上沿用的同时，也让明朝官场的腐败气息顺势渗透进来。当然这种官场的腐败也并不是明朝特有的，但却是明朝末年最为突出的问题，也是明朝灭亡最根本的原因。清朝作为一个刚刚建立的新政权，整顿吏治也是一种必不可少的图强之法。顺治皇帝在打击贪污腐败方面所做的努力，使得清朝这一时期的官场风气相对较为清廉，也为之后的康乾盛世奠定了很好的政治基础。