渤海郡是袁氏父子经营多年的基地，他们在这一地区的影响持续了十多年。曹操攻占渤海郡后，需要尽快树立起自己的权威，保证这一地区长治久安。
袁谭被杀后，曹操命令将其枭首示众，同时下令谁要敢来哭他，就把他的妻子、儿女一块儿杀了（敢哭之者戮及妻子）。曹操没想到偏偏有个人不怕死，跑过来向自己求情，要收殓袁谭。这个人就是袁谭在青州的属下，州政府秘书长（别驾）王修。
王修曾劝袁谭兄弟和睦相处，共同对付曹操，袁谭不听。袁谭被杀时，王修在高密，他本有机会逃命，但听说主人已死，就跑来吊丧，一下马便哭着喊道：“没有主人了，还能到哪里去（无君焉归）？”
曹操认为他是一个义士，就接见了他。王修说：“我受袁氏的恩德，如果能殓葬旧主，然后自己从容就戮，也没什么遗憾了。”
曹操深为王修的大义所感动，同意了他殓葬袁谭的请求。
曹操对王修原本就有好感，南皮攻破之后，他带人在城内巡视，曾到过一个官员的家里，看到其全部家产只有不满十斛粮食，几百卷书而已，联想到邺县被攻破时查抄审配等人家产数以万计的情形，当时就对这个官员留下了深刻印象。这个官员正是王修。
曹操礼聘王修到他的司空府工作，担任处长（司空掾），后来又兼任冶金部队司令（司金中郎将），这个职务主要负责矿山开采、冶炼以及兵器、农具的铸造，虽不是一个显要部门，却掌管着大部分“军工企业”，有着重要的地位。
王修干得很称职，一干就是七年，期间有很多次升迁的机会，但都因为曹操实在找不出比王修更合适的人接替他而作罢。为此曹操有点过意不去，专门给王修写了一封长信，表明司金中郎将一职的重要性和对王修工作的肯定。到后来，王修终于改任魏郡太守，在地方治理方面卓有成绩。
在此前后，曹操先后以司空和冀州牧的身份颁布了一系列命令，恢复冀州地区的生产和生活，整顿社会秩序。这些命令包括《蠲河北租赋令》、《抑兼并令》、《赦袁氏同恶令》、《整齐风俗令》等。
在《蠲河北租赋令》中，曹操下令免除冀州地区建安九年（204年）全年的田租和赋税，以恢复和发展生产。这道命令的颁布，受到了百姓的拥护。
袁绍统治冀州期间，政治和军事上依靠豪强地主，使得这些人的政治和经济势力迅速膨胀。长期以来，曹操一直在思考东汉政权在机制上的弊端，他认为豪强势力发展太快是造成政权衰弱的主要原因，所以对如何抑制豪强势力的问题十分关注。曹操认为如果这个问题解决得不好，即使得到政权也不会稳固，在关键时候上会被豪强势力们所左右。
基于这些长期的思考和对现实情况的分析，曹操颁布了《抑兼并令》，他强调一个社会“不患寡而患不均，不患贫而患不安”，任由贫富差距拉大，必然会带来严重后果。他说，像审配这样的家族，不仅经济实力很强大，而且成为窝藏罪犯的据点，是黑恶势力的保护伞，老百姓怎么能拥护这样的政权？
曹操借民意向豪强势力开刀是有深思远虑的，他不愿意在自己统治的地区出现豪门经济和豪门政治。作为抑制豪门的一个重要步骤，在《抑兼并令》中他明确规定，每亩地收租的标准是四升，每户另收二匹绢、二斤丝，除此之外一律不再收取其它赋税。他要求各郡县要严格检查，看看有没有豪强地主搭顺风车额外收取其它税费的现象，同时禁止弱势群体替那些豪强们交赋税。
攻占南皮后，冀州全境成为“曹统区”，那些曾在袁氏政权及军队里任职的各级官员，有的仍旧被录用，有的则心怀不安，害怕有朝一日会清算他们的旧账。针对这种情况，曹操在南皮颁布了《赦袁氏同恶令》，明确表示跟袁氏做过坏事的人，允许他们改恶从善（与袁氏同恶者，与之更始）。
袁氏政权之所以失败，一个重要原因是内部结党营私、勾心斗角很严重，这种风气由社会上层传达到社会的各个层面，成为一种不良风气。在过去的“袁统区”，不仅官员、豪强们操纵舆论、排斥异己、颠倒黑白，而且在一般老百姓里也存在是非不分、缺乏普遍的社会正义感、歪门邪道盛行等现象，针对这些问题，曹操在南皮又下达了《整齐风俗令》：
“结党营私是古代圣贤所痛恨的。听说冀州这个地方，父子也会分成两派，互相中伤争斗。以前直不疑没有哥哥，大家却说他与嫂子私通；第五伦三次娶的都是孤女，有人却说他虐待岳父；王凤独断专行，谷永却吹捧他为周代的申伯；王商忠诚，张匡说他搞旁门左道。这些都是颠倒黑白、欺君罔上的例子，整顿社会风气，以上现象不根除，我认为那是耻辱。”
曹操举的这些例子虽发生于前代，却都是有所指的。拉帮结派到了很严重的程度，就连父子兄弟也分成两派进行文攻武斗。他们没能给社会做出好的表率，以至于民风迅速恶化，不仅败坏了社会风气，也影响到社会稳定和生产发展。曹操花大力气整顿社会风俗，有很强的现实意义和迫切性。
经济上免除租税、抑制豪强兼并，政治上化解新旧势力的冲突，继而又从整顿社会风气入手，恢复社会秩序，曹操一系列政策的出台，很快使冀州的社会面貌得到改观，生产得到了恢复和发展。
在此期间，幽州的局势也发生了新变化。袁熙的部将焦融和张南看到袁氏集团即将覆灭，于是发动兵变，将袁熙、袁尚赶出幽州，二袁只得投奔辽西的乌桓首领蹋顿。蹋顿以前娶了袁家的姑娘为妻，跟袁家有姻亲关系，如今在辽西一带势力很大。
焦融自称幽州刺史，他率全州各郡县长官归降曹操。曹操大为高兴，幽州不战而胜，省去了远征的麻烦，他以朝廷的名义承认焦融为幽州刺史，将焦融、张南都封为列侯。在此之前，一直活跃在幽州的鲜于辅和阎柔已经加入到曹操阵营了。
鲜于辅在官渡之战前率部归附曹操，被曹操任命为北部边防军副司令（左度辽将军），封为亭侯，让他镇守在幽州，成为牵制袁氏集团的一股力量。官渡之战时，鲜于辅亲自率军到前线助战。袁绍败走，曹操听到报告欣喜异常，当时鲜于辅刚好就在旁边，曹操对他说：“年初的时候袁本初送来公孙瓒的人头，我看了都觉得眩晕（孤自视忽然耳），不想今天把他打败了，这既是天意，也是大家努力的结果啊！”后来，鲜于辅也参加了南皮之战。
鲜于辅的战友和同盟阎柔在北方少数民族中素有声望，鲜于辅曾经联合他以及刘虞的儿子刘和等人一直与公孙瓒作战。公孙瓒死后，阎柔也站在了曹操的一边，他被曹操任命为抗乌桓军司令（护乌桓校尉）。南皮之战后，阎柔又说动一部分乌桓、鲜卑等少数民族首领归附曹操，献上名马，阎柔被封为关内侯。
据《魏略》说，曹操很喜欢阎柔，曾经对他说：“我把你当成儿子一样，你也要把我当成父亲呀（视卿如子，亦欲卿视我如父也）。”阎柔于是跟曹丕等处得像兄弟一般。
有鲜于辅和阎柔，如今又有焦融、张南的归顺，幽州问题可以说初步解决了。但是没多久，幽州刺史部涿郡故安县（今河北涞水）人赵犊、霍奴起兵，杀死了刺史焦融以及涿郡太守，在袁熙、袁尚的鼓动下，蹋顿也趁机出动，在幽州刺史部渔阳郡北部的犷平（今北京密云水库北）一带进攻鲜于辅。
这一年的七八月间，曹操率部离开南皮进军幽州，在涿郡斩杀赵犊、霍奴，又渡过潞河救援犷平，这是曹军第一次北征幽州。蹋顿所部未作抵抗，撤到了塞外，曹操于是率军回师邺县。
建安十年（205年）十月，曹操回到了邺县。此次出征历时整一年，收获颇丰，曹军攻下了南皮，扫荡了幽州残敌，将袁熙、袁尚赶到了塞外，原来“袁统区”的北方四州中，已全部占领冀州、青州和幽州，不太有把握的只有太行山西面的并州，但高干即使想造反，也没有什么大碍了。