此后，就是袁克定组织太子党人马，意欲夺取军权。由袁世凯出面，要求担任模范团团长，不想段祺瑞摆出一张后娘脸，说什么也不同意，气得袁世凯说了一句：你看我来担任团长，行不行？
这本来是一句气话，谁也没料到最后竟弄假成真，袁世凯居然真的当上了模范团第一期的团长。
事情弄到这一步，袁世凯和段祺瑞之间的关系，已经彻底弄僵了。
在这节骨眼上，杨度跑了来，献计要搞掉段祺瑞。
杨度的办法，是先成立一个全国陆海军大元帅统率办事处，要用这个部门，驾空段祺瑞的陆军部。这个新部门将由中国最优秀的军事天才蔡锷担纲，段祺瑞这个部门，变成了只是办事的。
这一招好，谅段祺瑞无力招架。
无力招架就不招架，段祺瑞干脆不来上班了，消极怠工，以示抗议。正抗议着，袁世凯忽然把他叫到大总统府，询问他一件事。段祺瑞回答：这事儿我不知道，你等我回陆军部，问问徐世铮。
原来段祺瑞不来上班了，徐树铮那厮称霸陆军部，逮到公文乱发一气，根本不跟段祺瑞打招呼。
看到这情形，袁世凯脑子又犯了浑，叹息说：咱们这团体里，啊，是越来越不像话了，啊，芝泉在家做总长，啊，老是不来上班，啊，不上班……
到了这一步，按说应该有个明白人出来调解一下，都是北洋的老人嘛，何必弄得这么紧张？
但没有人有资格调解袁世凯和段祺瑞之间的不和，相反，两人之间的关系，成为了媒体关注的热点，让段祺瑞与袁世凯两人渐行渐远，彼此只能看到对方的背影。
接下来日本人弄出来“二十一条”，袁世凯立即精神抖擞，异常亢奋地琢磨招数应对。正忙得不可开交，段祺瑞突然递上来一纸公文，袁世凯以为是军方的表态，急忙打开，不想却是陆军部要求加薪的报告。
当时袁世凯气得就哭了，批了八个大字：
稍有人心，当不出此。
意思是说，段祺瑞啊段祺瑞，你但凡有一点点人性，一点点，只需要一点点，你就不会偏挑这节骨
段祺瑞也意识到自己有点儿不对了，“二十一条”都来了，非要这时候加薪，难怪让袁世凯骂你。于是为了弥补裂缝，段祺瑞又关起门来，搞了个对日宣战声明，通电各省督军，要求大家签字表态。
段祺瑞这么个搞法，大概是希望以军方通电签名的形式，表态支持袁世凯。不想他和袁世凯的冲突表面化，大家躲都躲不及，谁还会蹚这浑水？居然无人理会。正在郁闷之际，“二十一条”危机被袁世凯轻松化解，渡过了危局。然后袁世凯看到了段祺瑞要求对日宣战的声明，更加恼火，笑着说：芝泉老是唱反调，你要走就走嘛，何必口出恶声？
袁世凯把这个通电，理解成了段祺瑞反对他的意思，虽然这个误解很明显，但袁世凯不想解释，段祺瑞也不想，于是事态进一步恶化。
几天后，袁世凯召段祺瑞，见面就说：芝泉，你脸色不好，我看你还是休养一段时间再说吧。
段祺瑞无语，递上辞呈。
时间是1915年5月1日，北洋破裂。