这个世界上有透明人，也有可以让人变透明的药。
透明人因为不会被看见，所以没有人注意到他们的存在；然而，这个城市一定有这样的人。这是孤独少年阳一唯一尊敬的人——真锅先生说的话。
孤僻的真一不管是在学校，或是和同学或和妈妈在一起，都觉得很难融入，唯一能让他安心与信赖的人，就是这位真锅先生。但是，真锅先生为什么会知道这些秘密呢？
阳一住的小城发生了离奇的失踪事件，密室中的女人像水蒸气一样的消失了，阳一觉得只有透明人才有办法从密室把人带走而不被发现……
《透明人的小屋》有一个感人温馨的故事，和一个足够吸引人一气读到故事最后一页的优质谜团，虽然和岛田其他本格作品里华丽宏伟的谜团设计相比，这个密室消失的诡计，显得平凡得多。小说描写最棒的是男孩“我”和真锅先生之间亦父亦友的那份情感。从小失去父亲的“我”，在隔壁真锅先生那里获得了一份满满的父爱的填补，可是当看到真锅先生掀开母亲的裙子时，未懂事的“我”用小孩子的理解，把这种亲热当成一种对母亲的欺侮。
最后，真锅先生的离开，母亲的孤独终老，尤其是“我”在码头送别真锅先生的那幕，一种无可挽回的无奈和悲哀，被刻画得绵细入理。除了以往阅读岛田被作品里谜团设计的精妙所折服，这次从《透明人的小屋》里，也可见岛田深厚的文学功底，才能如此生动形象的从一个小孩子的视角，来叙述整个故事，既描绘了孩童的浪漫幻想，也写实了成人世界的残酷遗憾。不过有人将其列为青少年的推理读物，不太能够理解，因为里面厚重的现实，尤其是涉及日本和朝鲜的历史政治的部分，似乎不是一个青少年可以负荷和分辨的内容，甚至可能有负面的误导影响。