尤里安要是仅仅纠正前朝的滥权恶行，而没有惩治犯罪的人员，改革的工作仍旧不够圆满。在写给亲密友人的一封私函中，他提到：
我们现在能从海德拉吞噬一切的巨口里获得解救，真令人惊愕不已。我无意把这个称呼安在君士坦提乌斯的头上，他已过世，愿他平静地安息!但他那些奸诈而残酷的嬖幸，想尽一切手段来欺骗和怂恿君王，让他温和的天性被阿谀之言消除殆尽。不过，我的意图不是用高压的手段制裁这些小人。他们会遭到起诉，但为了维护他们的权利，一样会获得公正无私的审判。
他从政府和军队的高阶人员中，提名六位法官负责侦办这个案件，为了免于恶意的指责，说他是在公报私仇，就将这个特别法庭设置在卡尔西顿——位于博斯普鲁斯海峡亚洲这边的海岸，赋予审判官绝对的权力，可以宣判和执行最后的判决，不能推迟日期也不接受上诉。主席由年高德劭的东部统领，另一位同名的萨路斯特担任。[27]他的德行和地位，能够化解知名的希腊诡辩家与基督教的主教之间的争执，使双方修好如初。口才出众的马梅提努斯在旁协助，他是年度执政官当选人，最大长处是乐于为善、相信别人。但是这两位官员在民事方面的智慧敌不过内维塔、阿吉罗、约维努斯和阿尔贝提奥这四位将领的凶猛暴力。其中阿尔贝提奥被认为获得秘密的授权，公众要是看到他在酒馆里倒是很平常，如果他出现在法庭上，那就令人感到很惊讶。约维乌斯和海克留斯两支部队的领导人员，全部一身戎装，怒气冲天地围绕着法庭。法官在法律的公正和党派的叫嚣之间，受到影响而摇摆不定。
寝宫总管欧西比乌斯长久以来滥用君士坦提乌斯对他的宠爱，实行蛮横、腐败和残酷的奴性统治，为了惩治他种种不法行为，对他处以耻辱的死刑。保罗和阿波德尼乌斯被处死(前者被判活活烧死)，他们要为数百位罗马人的寡妇和孤儿负责。但这种赎罪的方式并不完全适当，因为这些人是遭到合法暴君的出卖或谋杀。但正义女神(要是我们用阿米阿努斯这种悲惨的表达方式)自己也要为乌尔苏卢斯的命运痛哭流泪。帝国财务大臣流出的鲜血，是对尤里安忘恩负义的指控，因在皇帝早年最不幸的时刻，诚实的大臣勇敢而慷慨地伸出援手。暴戾的士兵被乌尔苏卢斯毫不在乎的态度所激怒，认为案情严重，要判处他死刑。皇帝感到十分内疚并且公众也对此多加指责，个人受到很深的伤害，为抚慰乌尔苏卢斯的家人，把充公的家产发还。在这年的年底，他们用禁卫军统领和执政官的纹章旗帜装饰法庭。[28]托鲁斯和弗罗伦提乌斯向铁面无私的法庭俯首认罪，乞求大发慈悲饶恕他们的性命，前者被放逐到意大利的韦尔切利，但是后者被判处死刑。明智的君王应该奖赏托鲁斯的罪行，因为正是他的无能使得叛军高歌猛进，而他却拿恩主和合法君王的宫廷作为避难所。但弗罗伦提乌斯的罪行证明法官的严厉确实很公正，他逃避的行为更显出尤里安的宽宏大量。皇帝大义凛然制止告发人，不要为了图谋私利而进行辛勤的调查，即使自己非常气愤，也不愿打探这邪恶逃亡者的藏身之处。
卡尔西顿法庭解散后过了几个月，阿非利加的统领代理人书记官高登提乌斯和埃及公爵阿尔泰米乌斯，在安条克被公开处决。阿尔泰米乌斯是这个最重要行省的僭主，进行暴虐而腐化的统治；高登提乌斯长期以来用诽谤的手法，诬蔑尤里安本人和他的品格操守。然而审判和定罪的程序在执行时显得极为拙劣，对公众而言，他们像是君士坦提乌斯的支持者，因坚守忠诚的原则而遭到杀害，使得邪恶的罪犯反而获得莫大的光荣。至于服侍过君士坦提乌斯的其他人员，受到法条不咎既往的保护，可安享他们所接受的贿赂，无论是抵抗尤里安的军队，还是压迫孤独无依者，都不会遭到惩罚。这些措施在执行时必然会贬低皇权的无上尊严，但就治国最正确稳健的原则而论，实在值得我们的嘉许。尤里安因群众不断的请愿感到非常头痛，尤其是埃及人大声要求归还他们呈献的礼物，因为过去的政府行事太过草率或者违法。他预见到这令人困扰的案情会引起不断的诉讼，于是提出保证，要是这些埃及人能前往卡尔西顿，他愿亲自接见，听取他们的请愿并做出裁决。一般而言皇帝之言神圣而不可违背，但等这些人登岸后，他却颁布一道严厉的命令，禁止船员运送埃及人到君士坦丁堡。这些失望的当事人只有留在亚洲海岸，等到耐性和金钱全部消耗得一干二净，只能在不停的抱怨声中回到自己的家乡。
君士坦提乌斯招募了一支密探、特务和告发者大军，为使一人酣然入睡，不惜干扰数百万人的安宁，现在被心胸开阔的继承人全部解散。尤里安产生疑惧时会慎重处理，施展惩处时怀着慈悲心肠，基于判断、自负和勇气的效益，藐视叛逆的行为。他自认有莫大的功绩，相信他的臣民之中没有人敢在战场上与他交手，或者企图谋害他的性命，甚或坐上已空的宝座。哲学家能够理解不满情绪在仓促间发起的攻击，英雄人物瞧不起空有野心的计谋，知道叛逆分子会为情势所迫，完全谈不上机运或能力，全都无法胜任谋朝篡位的工作。安卡拉有个市民为自己准备了紫色的服饰，这只是轻率的违制行为，但在君士坦提乌斯统治之下，能够将其定为死罪。这个市民有个敌人，想尽办法向尤里安提出控告。国君派人经过详尽的调查后，就派告发者带着一双紫色的拖鞋，送给这位市民当礼物，使他的特殊嗜好能够增加光彩。一件更危险的谋叛涉及十位贴身侍卫，他们决定在安条克附近的训练场下手刺杀尤里安，但由于饮酒过量而泄露了阴谋，被链条锁着带到自尊心受打击的君王面前。尤里安把他们邪恶而愚蠢的行为数落一顿后，并没有像他们想象那样将他们处以受尽酷刑的死罪，只是把两名首恶分子宣判放逐之后结案。只有一件案例让尤里安违反了他已成习惯的仁慈作风，那就是处决一名少不更事的青年。他幻想这个青年用无缚鸡之力的双手，抢夺执掌帝国的大权。但是年轻人是骑兵将领马塞卢斯的儿子，这位将领在高卢战争的第一次战役中，背弃恺撒的阵营，成为共和国的叛徒。尤里安其实并没有因个人的气愤而任性施加报复，只是把儿子和父亲所犯的罪行混淆了，没有弄得很清楚。马塞卢斯的不幸使他得到了与君王和解的机会，对于公正的法律所施于他的痛苦，皇帝愿意尽力去治愈这个伤口。