有些年轻的日本人不太理解中国、韩国等国家一直以来对靖国神社的批判，认为靖国神社只是一个纪念战死者的地方。而从东亚各国政府的立场来看，真正让靖国神社成为问题的其实是合祀在其中的甲级战犯，日本首相对这些战犯的参拜“严重地伤害了东亚各国人民的感情”。
首先来看一下韩国和靖国神社的关系。从明治维新时期开始，日本政府内部就一直有着“征韩论”。之后日本国力逐渐增强，开始持续地侵略朝鲜半岛。终于在1894年，朝鲜半岛爆发了近代史上最大的内战——甲午农民战争。这是一场农民阶级发起的反抗压迫的独立战争，最后由于遭到包括日本军队在内的国内外势力的镇压而失败。在这场战争中，大量的朝鲜民众遭到日本军队的屠杀，而在这当中战死的日本将士们日后又大都进驻了靖国神社。此后的日俄战争、“二战”中，还有很多对朝鲜民众进行了杀戮的日本将士陆续在靖国神社被供奉了起来，这怎能不引起韩国的抗议？
而对于很多中国人来说，靖国神社是一个“十恶不赦”的地方。在靖国神社中，因侵略中国而战死的日本将士数量约为44万，这其中包括了“九一八事变”中的17176人和抗日战争中的191250人。与之相比，光是在抗日战争中伤亡的中国人就有3500万人。特别是南京大屠杀、“731”部队、慰安妇问题等事件的发生，更是让很多中国人无法认可靖国神社的存在。
那中国政府的立场呢？1972年中日恢复邦交时，中国政府就已经对侵华战争进行了明确表态。在《中日联合声明》中，中国“放弃对日本国的战争赔偿要求”，并且表示“侵华战争是日本的少数军国主义分子所为，日本人民也是这其中的受害者”。这里的“日本人民”也包括了在中国战死的那些日本将士。但甲级战犯是另一回事了，因为他们所对应的正是“少数军国主义分子”。
和中国、韩国不同，朝鲜方面对于靖国神社的公开表态并不多。一直以来朝鲜都没有和日本建立邦交，两国关系交恶，只维持着事实上的外交关系。1997年金正日上台后，有关朝鲜的报道开始成为世界媒体的头条。2001年8月13日小泉纯一郎首次参拜靖国神社之后，朝鲜的外交部发言表示：“13日，小泉纯一郎首相不顾日本国内外反对参拜了靖国神社……这种行为是引起侵略战争的军国主义的延续，严重威胁了热爱和平和正义的朝中两国人民的关系。”在之后的两年间，朝鲜官方都公开发表了类似的抗议，朝鲜媒体进行的有关靖国神社的报道也年年增加。
和中、韩、朝三国义正词严的抗议相比，中国台湾对于靖国神社的态度就暧昧了不少，内部主要分裂为支持和反对两大派别，大致上来说也就是以李登辉为首的台独势力和以国民党为中心的反台独派。2005年4月5日，台湾团结联盟党主席苏进强参拜了靖国神社。紧接着6月份，台湾原住民代表高金素梅就在靖国神社门口和日本右翼团体以及警方对峙，要求带回高砂义勇队中牺牲的祖先的魂灵。所谓高砂义勇队，就是“二战”期间日军在台湾原住民当中“招募”的一支作战组织。先后一共有两万名左右的台湾原住民以高砂义勇队的名义被送往东南亚作战，这些人的生还率不到1/3。依照靖国神社的合祀标准，这些台湾原住民在日后都被供奉进了靖国神社里，而这也正是台湾原住民团体无法接受的。
最后再来看一下东南亚各国的反应。东南亚各国政府对于靖国神社的参拜问题一直比较低调，媒体上的报道不如中国和韩国激烈。在东南亚诸国之中，态度最强硬的要属华人众多的新加坡。另外，由于东南亚的很多国家都受到了来自日本的经济援助，在实际的经济援助面前，靖国神社问题的严重程度可能就随之减轻了。