宫野明美醒来的时候，头顶天花板的颜色是苍茫的白色。
床边坐着的年轻女孩看见她醒过来，惊喜地道：“你醒啦？没事吧？有感觉哪里疼吗？”
宫野明美茫然地看着她：“你……”
“我叫毛利兰！”女孩笑着道，“我们之前见过一次的。我弟弟在撤离的路上看见了你，就把你带到医院里来了。”
“……谢谢。”宫野明美坐起身。
叫做毛利兰的女孩说：“哦，对了。灰原小姐，之前有个人给你留了一封信，说最近比较忙，很多事情没办法和你说清楚，也没办法陪你，所以让你看一下信，等以后有时间了他再来找你。”
宫野明美一时间忘了她说的“灰原小姐”，只能压抑着心里的惶恐，慢慢地问：“谁？”
“一个戴着针织帽的男人……”毛利兰说着把床头柜的信拿过来递给她，“你慢慢看，我先出去给你削个苹果。”
黑发的少女走出去。宫野明美摸了摸自己的头，摸到了一头短发，除此之外，她的形态完好无损。
这是怎么回事……
抱着这种疑惑，她打开了那封疑似是赤井秀一给她的信。
【明美：
抱歉这样和你说话，但是FBI近来时间紧迫，我只能采用这种方式。以下是我要告诉你的所有事情：
琴酒和马尔萨拉联合布置了你的假死计划，如今你在组织里已经不存在了。所以“宫野明美”这个身份请抛弃，有人帮你换了一个“灰原真纪”的身份，并且给你安排好了新的住所。
你的新身份：灰原真纪，二十三岁，网络画手，有一个远在家乡的妹妹灰原哀，待人温和有礼，也诚实善良。总之，是你自己的性格，不用特意扮演。至于灰原哀，据说将是宫野志保的新身份，请你为她做好一些准备。有关更加详细的身份说明，都在你的房子里。
以下是你的家庭住址：米花町二丁目23番地。
信封里附带手机、钥匙、现金卡、信用卡、驾驶证等必需品和一些现金。
祝你以后都生活愉快，真纪。】
宫野明美……或许现在应该叫她灰原真纪，她看着面前的信，还有信封里倒出来的手机和钥匙等物，慢慢地、慢慢地捂住了自己的脸，把自己缩了起来。
在极致的恐惧与不顾一切投身的绝望之后，她终于迎来了新生。
“可以休息一下了。”北川星窝在床上说，“这下就等雪莉知道姐姐自杀的真相，然后逃离组织了。不过因为柯南并没有提前和明美遇上，所以现在要找个理由让她往23番地走。”
“让琴酒把她逼过去吗？”
北川星把脑袋埋进被子里：“不想想了，让我亲爱的哥哥和战友们自由发挥吧。”
亲爱的哥哥和战友们表示现在很想打她。
得知了主谋者的态度之后，琴酒黑着一张脸和青木花枝做好了接下来的安排。而铃木司也在忙活的间隙里给北川星提了几个建议，这些都被北川星原封不动地转述给了琴酒。
而江户川柯南也发现了宫野明美的存在，开始借小孩子的身份旁敲侧击地问她一些问题。但宫野明美拒不承认自己知道。
再加上绿川朝在混乱之后的重新出现，让柯南起了疑心，双方都对对方抱有猜测和怀疑之时，接触次数呈指数型上升。
对绿川朝来说，江户川柯南的习惯他太熟悉，而且容貌也和幼时的工藤新一一模一样，甚至有的时候，这个按理来说曾经与他无关的小男孩会说出一些他曾经的习惯。比如“以前也这样”。
工藤新一下落不明、江户川柯南举止异常、北川星的实验研究，都在告诉他，这个孩子很有可能和组织产生过关系。
“我认为柯南就是新一。如果拿指纹对比，得出来的也应该就是这个答案。”
绿川朝保养着枪支，身边坐着安室透。对方正戴着眼镜看着文字密密麻麻的文件，闻言偏了偏头，道：“他是怎么弄成那个样子的？”
“你忘了小星星的研究？忘了组织的代表性话语？——We can be both of God and the Devil.Since we are trying to raise the dead against the stream of time.（我们既是上帝也是恶魔。因为我们要逆转时间的洪流，让死人复生。）”
“小星星的研究里就有写倒退时间，她的报告上有很多类似的‘存活变小’数据。”绿川朝道，“新一应该就是在什么时候碰见了组织的人，但是因为当时的这款药存活率太低，所以就直接被当成毒.药给他吃了。”
“当然这只是我的猜测，还没有确切的证据。”绿川朝将枪重新组装好，然后放在了自己面前，又朝安室透伸了伸手，“给我吧。”
安室透一边从手边拿过自己的枪递给他，一边道：“嗯……我是想问他是为什么会和组织的人碰上，莫非是在谁进行交易的时候，但是一般来说这种不在任务当中的活都是会有人来进行后续处理的，按理来说来处理的人没看见尸体，应该会回复给下手的人，下手的人再重新去找。但是目前为止似乎没听到类似的消息。”
绿川朝道：“也就是说，有三种可能？”
“嗯，要么处理的人没上报，要么上报了但是下手之人没在意，要么就是故意的。前两者好理解，但是最后一个猜测就很耐人寻味。是谁想要将工藤新一变成小孩子，是打算把他当成一个试验品观察药效，还是有其他的目的。”
他看向绿川朝：“不管怎么说，为了查明真相也好，为了保护他也好，我们可能要在那孩子身边待一段时间了。”
绿川朝点了点头。
这就是一个星期后毛利兰和江户川柯南在楼下的波洛咖啡厅看见安室透的原因。
许久不见的人突然出现在自己的面前，毛利兰惊讶地说：“降——”
安室透打断他们的话：“我是新来的服务生安室透，请问两位客人需要些什么吗？”
两个人瞬间明白了，装作不认识的样子，客气地说：“三份三明治，两杯牛奶一杯咖啡，谢谢安室先生了。”
安室透笑着道：“好的，请两位在这边就坐。”
咖啡厅本来也不是什么正经吃饭的地方，座位少环境好，仅有的两名服务生一位是安室透，另一位是早就在这里的櫌本梓小姐。
安室透为他们引领的位置在一个年轻女人旁边，她戴着帽子，低着头吃着三明治，当安室透走过来时，身体还僵硬了一下。
江户川柯南看着她道：“灰原姐姐？你怎么在这里啊？”
“灰原姐姐……？”毛利兰侧头过去，看清楚旁边的人，惊讶地道，“真的诶，是灰原小姐，您也住在这附近吗？”
“……不。并不。”灰原真纪小声地说道，“我只是过来找人的。”
“嗯？”毛利兰看了一眼咖啡厅里的所有人，“是来找小梓小姐吗？”
“是的。”灰原真纪吃完了三明治，头也不抬地道，“抱歉，我临时有点事，先离开了。”
她匆匆忙忙地起身走到柜台边，迅速地付了钱，连和櫌本梓说再见的时间都没留，就跑得人影都不见了。
和毛利兰有些奇怪地看着她的背影询问櫌本梓不同，江户川柯南把她的怪异身份和改了名字的安室透一联系，就得出了一个大概。
灰原真纪之前和黑衣组织的人认识，但是看她的样子很像是被逼迫的，他认为是她那天晚上趁乱逃了出来，才会被他在公路边的草丛里看到，然后又被他和另一名警察一起送到了医院。因为是逃出来的，所以能够解释换了房子住的事情。
但是有一点江户川柯南不太清楚，那就是他的记忆和阿笠博士说的话都表明，旁边的那栋房子很早以前就被人买了下来，只是直到最近一两年才动工装修处理，随后，就只有灰原真纪住在里面。
也就是说灰原的逃出很有可能有其他人帮助，有可能是他们中途拦截从原户主手里买下了这间房，还有可能就是帮她脱离这件事很早以前就有人在规划。
他更倾向于后者，同时这也就说明，灰原真纪和组织认识的时间很长，甚至说不定，她就是在组织里长大的。那她那个“在老家还没过来的妹妹”，十有八九也是组织的成员，甚至依照灰原真纪表现出来的性格，姐姐是被放养的，而妹妹是被抓在手里的，且两方都是对方的软肋。
灰原真纪说不定是个假名，她那“很快会过来的妹妹”，指的应该就是妹妹最近要离开组织，和姐姐一起生活。
但是那个以酒为代号的组织会放过他们吗？柯南想起来之前和琴酒有过的交集，对方的每一步都阴狠毒辣，不把人命放在眼里。
如果让他们知道了灰原的存在……
他压下这个疑虑，转而想灰原真纪不对劲的状态，她这个模样表现出来的就像是在避着某人，排除櫌本梓、他和小兰三个人，再加上化名去卧底的安室透。他怀疑安室透卧底的组织就是酒厂，而且他和灰原真纪见过面，但是灰原不认识他。
也就是说，背后有人很有可能是公安？安室透七年前没了消息，这个时间正好早于23号房子被买下来的时间，也就是说，是公安把灰原真纪带出来的？灰原真纪并不清楚安室透是卧底也能够理解，卧底的事情越少人知道越好，特别是她这种和代号成员有关系的人。
等等，那么灰原真纪和安室透见过面，他是不是能够推测，安室透是代号成员？
他一瞬间兴奋起来，这就表示身为卧底的安室透能够为他提供更多的信息，而他也能放心地让他知道自己的真实身份。他们两两合作，比他一个人单打独斗要好得多了！