现在, 浅川爱梨他们所在的是真正的贾巴沃克岛——未来机关的研究设施基地里, 2-B班除了狛枝凪斗之外的全员都从【新世界程序】里苏醒了过来。
在他们集体接受治疗的时候，就见班主任雪染千纱眼睛红肿地守在一边, 她的身边站着一脸担忧自责的御手洗亮太和造成他们失去记忆的罪魁祸首——【超高校级的神经学者】松田夜助。
由于刚从实验舱里出来，四周是嗡鸣的机械音，【新世界程序】里的记忆和重生前的记忆混杂在一起, 浅川爱梨总有种“既然没有发生绝望事件为什么他们会在程序世界里自相残杀”的懵圈。
她努力地回忆着自己进入程序前的记忆，但仅仅能想到的只是修学旅行最后一天的晚上。她提前上楼, 前往四楼的小型电影院, 将笔记本连在了投影仪上，以便大家一上楼就可以一起观看视频, 然后因为吃得有些撑, 在准备完一切后就跑了一趟厕所……
在厕所里，她看见了正在梳妆打扮的音无凉子，在和她打招呼的时候却突然失去了意识。
再睁开眼睛的时候, 就是被篡改和抹去了记忆, 强行带入了【新世界程序】里。
浅川爱梨是在厕所里失去了意识，但除了浅川爱梨以外的所有人都说浅川爱梨和他们一起看了视频。她姗姗来迟后将灯关上, 坐在了狛枝凪斗的身边。
大家是在看视频的过程中，感觉有奇怪的画面在脑海里闪过, 然后失去了意识。
直到雪染千纱和御手洗亮太抱歉地叙事整个事情的经过, 浅川爱梨才了解了他们进入【新世界程序】的真正原因。
未来机关是由希望之峰学院的毕业生们创立的一个组织。会长天愿和夫和副会长宗方京助在贾巴沃克群岛上建立了多个研究设施，启动【新世界计划】是由于一部分参与暴动的预备学科的学生出现了严重的心理问题，所以在那次事件后, 未来机关开始研究开发【新世界程序】，用于帮助陷入绝望的学生们和绝望残党们重获希望。
除此之外，就正如浅川爱梨在搜查中找到的未来机关的邮件——为了洗脑神座出流和江之岛盾子，让他们成为未来机关宝贵的战力。但这个【新世界程序】却反过来被他们利用，被江之岛盾子植入黑白熊病毒后，篡改为了【绝望再生程序】。
而那天，所有人在观看视频后会集体失去意识，是因为【超高校级的动画师】御手洗亮太制作的视频能干涉到观看者的大脑。
通过色彩的变化刺激视觉中枢，通过诱导眼球的动向进行体验记忆的认知操作，通过声音来控制集中力，他所拥有的才能完全可以被称为洗脑技术的东西。
所以，江之岛盾子自第一眼遇到御手洗亮太后，就对他的动画师才能非常感兴趣。之前绑架失败过了一次，而这次，她直接在他们制作的视频里动了手脚。
没有把御手洗亮太也带进【新世界程序】，是因为江之岛盾子的计划中需要他将他们自相残杀的画面制作成洗脑视频，用于向整个世界传播绝望。
而他们那晚看见的浅川爱梨是由才囚学院的白银紬cos扮演，她因为非常崇拜江之岛盾子而加入江之岛盾子为领袖的绝望集团。
虽然不是希望之峰学园的学生，却有着【超高校级的COSPLAYER】的才能，拥有一秒换装并能将任何虚拟人物完全再现的能力，即变装和变声，但因为COS的是现实世界中的人物，所以白银紬在假扮浅川爱梨的时候，全身皮肤过敏性发着红斑，被狛枝凪斗当场戳穿。
而将他们带进贾巴沃克岛的正是她假扮的雪染千纱。
雪染千纱是未来机关第五支部支部长，有权启动【新世界程序】。与此同时，贾巴沃克岛也被绝望残党们成功占领。
浅川爱梨搜查时找到的那些关于【希望之峰学园史上最大最恶的绝望事件】和【人类史上最大最恶的绝望事件】的漫画书，其实是江之岛盾子用【超高校级的分析师】才能预测出来的未来。
这位【超高校级的绝望】预想中的【希望之峰学园史上最大最恶的绝望事件】会引发了外界的一系列暴力事件，从而爆发【人类史上最大最恶的绝望事件】，这就是【希望之峰学园史上最大最恶事件】对于江之岛盾子而言的意义。
但是，预备学科的暴动在浅川爱梨他们的干预下以失败告终，对初次享受到失败的绝望的江之岛盾子自身而言，这并不是终点，应该说她也预料到了失败的可能性，而开始准备策划起全新的【绝望】——利用的就是他的青梅竹马【超高校级的神经学者】松田夜助。
由于不知道江之岛盾子和松田夜助是青梅竹马的关系，学园理事会委托松田夜助对江之岛盾子和战刃骸进行心理治疗。其实是想从她们嘴里问出其他绝望残党的下落，解明整件事的真相，而掩盖这起事件。
而被困在监狱里的江之岛盾子，其实早就想出了一个越狱的方法，应该说，她早就预料到了松田夜助会来治疗她们，也知道他会想办法来救自己。
在绝望残党的帮助和松田夜助的踩点下，江之岛盾子越狱成功。
第一个发现监狱里并不是江之岛盾子本人的是逆藏十三，当他要告诉宗方京助的时候，就发现江之岛盾子放了一份威胁信，正是自己喜欢宗方京助的把柄。
逆藏十三为了掩藏此事，被迫受到江之岛盾子的威胁，对她已经偷梁换柱越狱的事实睁一只眼闭一只眼。
为了让江之岛盾子逃过学园的追查，松田夜助对外宣称的失忆医治，其真实目的是为了持续使她失忆，并让江之岛盾子化名为音无凉子。
松田夜助没想到的是，伪装成江之岛盾子的战刃骸出现在修学旅行里，一直不停地给音无凉子暗示自己不是江之岛盾子。
实际上这也是依照着江之岛盾子所编造的剧本来行动，为的就是唤醒江之岛盾子的记忆。
无论是江之岛盾子的失忆，还是战刃骸的变装，都是今后的“更加绝望的计划”的重要要素之一。
记忆制御的实验。
战刃变装的实验。
将他们带进【新世界程序】里进行互相残杀也是，是为了制作影像以让绝望进行蔓延——都只是实验而已。
一切，都是兼具了实践和实验的一箭双雕。
因为希望之峰学园的学生们被公认是“希望的象征”，通过播放他们为了“保全性命”的希望，绝望地展现互相残杀的姿态，将观看到这个视频的人们一起打入绝望的深渊，就是江之岛盾子的目的。
于是，恢复记忆的江之岛盾子，为了让这群“希望的象征”成为【超高校级的绝望】，为了让他们日后在各自的领域散播绝望，对一般市民进行洗脑，更重要的是为了引诱未来机关掉入自己精心布下的陷阱内，将他们一起带到了贾巴沃克岛，将病毒黑白熊植入了【新世界程序】。
并在公园的倒计时之内，将这个程序篡改为了【绝望再生程序】。
一切都是为了【人类史上最大最恶劣的绝望事件】的开幕。
由于白银紬的伪装，希望之峰学园并不知道修学旅行发生的事情。
直到五日后，一名晨跑老人在野灌丛里发现了一具男性的尸体，正是不远处别墅区的保安。
经法医诊断，被害者死亡时间是在五日前的晚上九点到十二点之间。介于死者是位中年男性，要杀害一个身强力壮的男性，且死者颈部有两条明显的不同方向的索沟，一道不太明显，呈水平状环绕颈部；另一道较明显，在两耳后上升而消失，从而判断为勒死后伪装自缢而悬尸。于是凶手是男性的可能性较高。
然而凶手却是【超高校级的军人】——战刃骸。
这具尸体正是音无凉子亲眼目睹被绳子无情地吊在树上，随后消失不见的那名中年男子。
警方在寻找目击证人时发现原本应该结束的希望之峰学园的修学旅行，但学生们并没有回家，而是被班主任告知修学旅行仍需要进行半个月之久。
希望之峰学园立刻出动寻找在修学旅行中消失的学生们。
无论是警方还是学园，谁也没想到江之岛盾子会带他们前往贾巴沃克岛。
这一周，由于浅川爱梨他们的脑中进行过特定记忆的扫描，还是强制关机脱出的【新世界程序】，担心他们脑部产生器质性的异常，未来机关将他们像小白鼠一样地进行着各种检查各种研究，并全方位做着心理疏导和对【新世界程序】数据的采集与记录。
让学园震惊的是，明明在进行“希望育成计划”时，已经将试验者身上对于获得才能会形成阻碍的感觉与感情与思考与兴趣全部被剔除，原本的人格与记忆也被全部洗去。但醒来的神座出流，却在保留所有才能的情况之下，恢复了日向创的人格和记忆。
所以，与浅川爱梨他们不同，日向创在醒来后就被当时负责这项计划的实验人员单独地隔离在了一间实验舱里。
他全身插满着试验管道，每日记录着身体的各项数值，进行着全身的诊疗和观察。
没有人知道恢复日向创人格的神座出流是否真正的消失，还是像之前日向创的人格一样暗藏在他潜意识的深处。
但，对于【新世界程序】竟然能挖出神座出流大脑深处的记忆，将感情和思考按照以前的数据重新构筑，实验人员都感到非常的不可思议。应该说，幸好出现在【新世界程序】里的是日向创，如果是神座出流……或许就会和江之岛盾子狼狈为奸了吧？
毕竟，这家伙明明没有中招，却帮助江之岛盾子一起到达了贾巴沃克岛，甚至自己也一同进入【新世界程序】。或许就是无聊得没事做，所以……？
实验人员是这样想的，但这几日，记忆逐渐复苏的日向创却认为完全不是那样的。
在脱离【新世界程序】时，他听到的那个声音，毫无疑问是神座出流的意识。
拥有所有才能的神座出流恐怕早就预料到了这一切吧……无论是江之岛盾子的计划，还是【新世界程序】会重新构筑出日向创的人格，其实他早就预料到了吧？他甚至比江之岛盾子预料得更多，让江之岛盾子的计划成为自己计划的垫脚石……为的就是恢复日向创的人格和记忆。
“早就发现了音无凉子就是江之岛盾子，却一直将计就计地帮助江之岛盾子欺瞒大家……你也早就预料到了吧……在变回日向创的人格后，神座出流就不再存在于这个世界上了……但即使面临自己即将消失的命运，却还是愿意让我回来……为什么愿意为了我做到这个地步呢……？”
“其实不是为了我……而是不想她们露出失望的表情吧……爱梨和七海她们一直努力地想让你恢复我的记忆……你才想把属于她们的日向创还给她们吧……”
“别以为我猜不出你在想什么……现在的我也是拥有【超高校级的分析师】才能……”
“知道自己即将和大家分别……所以，默默地拍了大家的照片，还帮爱梨一起制作了视频吧？……视频我也看了呢……明明认为做什么都很无聊的神座同学……其实意外的是个非常温柔的一个人呢。”
“但你也太信任我了吧……”
前所未有长度的黑发让日向创醒来至今都十分的不适应，原本草绿色的眼睛也变成了草绿色和红色的异色瞳。
他望着镜子里完全不同的自己，微微扶着额头，有些抱怨地碎碎念道：“如果我最后真的被江之岛盾子洗脑得一蹶不振怎么办……？在得知强制关机后，自己要消失在这个世界上时，我可是真的差点就要放弃了……”
“就那么信任我一定能打败绝望吗……？”
没有人回答日向创的自言自语。
“神座出流，谢谢你。”
“七海同学说得对。拥有才能并不是重点，比起是否拥有才能，还有比这更重要的事情。”他微笑着，唇尾微翘，伸手轻触着异瞳的双眸。
“所以，我会连你的那一份，一起创造出属于自己的未来。”
“日向！你剪头发了？”浅川爱梨去探望解禁的日向创的时候，就发现神座出流那标志性及腰的长发已经短到了耳后，整个造型已经从长发飘飘的神座姐姐变成了呆毛竖起的日向创。
“嗯，头发有些长，洗起来太不方便了……”日向创爽朗地露出笑容，没有这一周被各种实验折磨得一脸憔悴的模样。
“总觉得……日向君和以前不太一样了……”七海千秋歪了歪头，望着日向创一眨不眨的，“以前的日向君总是垂着脑袋……现在感觉变得更有信心了！”
被七海千秋左看看右瞧瞧的日向创，头顶的呆毛立刻紧张得像电线一样地直立起来。他下意识地挠挠头，脸颊红红地移开了目光：“抱歉，让你们担心了。现在的记忆基本都恢复了……”
“那神座同学……是消失了吗？”浅川爱梨关心地问，七海千秋也紧张地攥紧衣袖。
“大概……没有吧？总觉得他还在我的身体里……时时刻刻地监督着我……”
他微微低头，轻笑了一下：“神座那家伙，以为你们都不需要他……如果知道你们挂念着他的安危的话……或许会后悔把身体还给我了吧……或许哪天觉得我做得不够好就来抢夺我的身体呢？”日向创半开玩笑地说。
无论如何，现在的日向创，都已经不再是以前那个退缩软弱不自信的日向创，而是拥有着【超高校级的希望】才能的日向创。
“似乎做好出航的准备了呢……”想到终于能回去见到母亲和花村食堂，从码头跑回来的花村辉辉一扫从程序世界醒来后的迷茫和焦躁，精神亢奋地开口，“我们终于能回去了……！”
“……爱梨……这样真的可以吗？在狛枝醒来之前，留在这个岛上……？”前来迎接他们的轮船已经停靠在了岸边，小泉真昼担心地望着为他们送别的浅川爱梨，依依不舍地拉住她的手，“雪染老师说……还睡着的狛枝醒来的可能性是微乎其微……”
“不，凪斗一定会醒来的。”浅川爱梨摇摇头，十分坚定道，“因为他是【超高校级的幸运】呀，哪有大家都醒来的情况下，只有他长眠不醒呢……我相信他和他所拥有可以成为奇迹的才能。”
“虽然狛枝那家伙总是搞事情，但不可思议的是……我也觉得他会醒来……他的幸运总是匪夷所思的……所以……”左右田和一挠挠脸颊，开口道，“对于这种人，奇迹也一定会化为必然而降临吧？”
“一定会的！我也相信狛枝君！”
“爱梨，我们也留下来吧。”
谢绝了罪木蜜柑和七海千秋都想留下来的好意，浅川爱梨笑着催促同学们上轮船：“你们不必担心我们，先回去吧！已经近一个月没有回去，家人一定很担心。”
2-B里除了浅川爱梨不愿意离开外，只有日向创被迫留在贾巴沃克岛上。
除此之外，还有和【新世界程序】有关的【超高校级的程序员】不二咲千寻，和【超高校级的神经学者】松田夜助，正在贾巴沃克岛上和治疗师们一起研究着如何让植物人状态的同学们苏醒过来。
目睹江之岛盾子被抓的松田夜助最初在什么都不知道的情况下，是真心将江之岛盾子救出的。为了躲避学园的追捕，将她化名为“音无凉子”，想要保护她不受伤害，也一直都在努力地不让她回想起来。
但，在修学旅行中，他从神座出流口中得知了江之岛盾子真正的目的——这一切都是江之岛盾子的计划，只是为了看自己充满绝望地死去，并品尝着杀死自己的绝望。
现在没有杀死自己，只是由于进入【新世界程序】时，需要他帮助消除大家的记忆。当江之岛盾子的【全人类江之岛计划】成功之后，就是从【新世界程序】中出来的江之岛盾子杀死自己品尝绝望的时刻
他清楚地明白，自己想保护江之岛盾子的心情才是……真正的绝望吧。所以在不终止它之前……这份绝望将永远不会终止。而，为了避免让更多的人被拉入绝望之中，这一切的一切就应该由他来终止掉。
在经历了很长的心理斗争后，松田夜助决定利用【新世界程序】将江之岛盾子的人格杀死。
这是一场豪赌，和神座出流的目的一样，他想要救的是那个喜欢自己的音无凉子。
——唔噗噗噗！从最开始音无凉子这个人物就哪里都不存在哦！唔噗噗，真是要笑出来了呢！绝望过度到要笑出来了呢！
不是的。音无凉子存在过。
所以，他不允许……音无凉子就这样被江之岛盾子终结了一生。
对神座出流和松田夜助这两位明知道江之岛盾子的计划却推波助澜以达成自己目的的搞事党，目前对于他们的处罚，学园长和理事会仍在激烈争论中。
在理事会最终定论前，他们不得离开贾巴沃克岛。尤其是松田夜助，必须将所有昏迷的学生全部救醒。
至于战刃骸，自【新世界程序】中醒来后就被未来机关控制了起来。
关于战刃骸相关的事情，浅川爱梨还是从苗木诚口中打听到了一些前因后果。
苗木诚这一届和他们一样进入了【新世界程序】，在里面看见的场景是希望之峰学园。一只自称学园长的黑白熊突然出现，提出各种逼迫或利诱他们杀人的动机。
但与浅川爱梨玩过的弹丸一不同的是，这次并没有发生自相残杀事件。
苗木诚误中江之岛盾子在“假出逃装置”上设置的机关，在舞园沙耶香前来打算换房间时毒发被送去医务室，所以打断了舞园沙耶香的杀人计划。
他还在那儿和冒充江之岛盾子的战刃骸交了朋友。所以，江之岛盾子用□□杀害战刃骸时，苗木诚冲上去将战刃骸救下，自己反而受了重伤。
因此，一直跟随着江之岛盾子并帮助她完成计划的战刃骸因被苗木诚拼死所救，躲过了被冈格尼尔之枪贯穿身体而死的结局，同时因为江之岛盾子的背叛，站到了苗木诚等人一边，决心给予江之岛盾子绝望，即帮助苗木诚等人获得希望。
所以，在最后的毕业试验中，面对左右各五十只自爆的黑白熊，以及最后的脱出开关处的黑白熊，战刃骸选择了投掷铁棒吸引江之岛盾子的注意力，然后凌空跃起，与大神樱向着自己发出的回旋踢组合，以黑白熊为标发射出了自己的身体，突破了被暴风与绝望的廊下，然后用膝盖将最后一只黑白熊的□□与主控制系统摧毁，拿回了脱出开关。
这就是他们全员平安逃脱的来龙去脉。
77期生和78期生，另两个班级就没有那么好运了。
自相残杀发生后，一部分学生遭洗脑后已经坠入了绝望的深渊，另一部分学生则在【新世界程序】中死亡，和狛枝凪斗一样至今昏睡不醒。
所以，江之岛盾子这个让他们集体沦为【超高校级的绝望】这个计划本是万无一失的，但她错误估量了几件事。
无论是战刃骸，还是松田夜助。
无论是狛枝凪斗，还是浅川爱梨。
还有，其实从最开始就在利用她达成在程序世界中挖掘出潜藏记忆的神座出流。
江之岛盾子最后还是败给了那些被自己设计的却在绝望中团结起来的希望之峰学园的学生，最终被自己孕育出来的绝望所吞噬。
或许，这本就是她所预料到的结局，也是她想要体验到的绝望。
这半个月的时间里，在【新世界程序】中已经死亡的人的人格数据，已经由不二咲千寻在电子层面上修复了。但由于死亡时产生的心理障碍，对他们的精神层面产生了伤害。
他们的大脑两半球发生结构性破坏，造成自觉的思维活动能力的丧失，但间脑与脑干的功能有充裕的保留，呼吸功能也没有停止，因此一些自主神经反射与运动反射都有保存，被判定为植物人状态。
昏睡的这半个月，浅川爱梨每日为狛枝凪斗检查血压与脉搏，并进行心电图检查，以明确心脏输出充足。
她更是日夜守在狛枝凪斗的营养舱旁边，每天都和狛枝凪斗聊着天、讲着他们以前的事情，并帮他擦拭着越来越虚弱消瘦的身体。
她等待着他的苏醒，从最初的信心满满，逐渐变成了担心和害怕。
之后又过了半个月后，不二咲千寻发现了一种能唤醒植物人意识的方法。那就是精神潜入在【新世界程序】里死亡的人的意识世界里，直接破坏他们精神层面的伤害。直白的说，就是将他们现在所处的精神世界完全破坏，以达成强制唤醒的目的。
虽然只有50%的成功率，但不二咲千寻专门制作的用于精神潜入的Alter Ego，可以多次尝试，因此同学们基本都苏醒了过来。
只有狛枝凪斗那里，尝试了几次都以失败告终。狛枝凪斗的精神世界就如同一个深不见的漩涡。由于他的精神力太过强大，造成进入他精神世界的Alter Ego都纷纷死机。
“浅川前辈，你要进入狛枝前辈的意识世界？”因为一直失败而有些一筹莫展的不二咲千寻吓得声音都变调了，他慌张地摇头，忧心忡忡道，“不行不行！这样做是非常危险的！……浅川前辈如果失败的话……就会被狛枝前辈的意识所吞噬……然后……也再也醒不过来了……所以……不能做这么危险的事情！还是我制作一个浅川前辈的Alter Ego……”
然而，浅川爱梨的Alter Ego也同样在狛枝凪斗的精神世界里遭遇了滑铁卢般的大失败。仿佛，狛枝凪斗的精神世界有着严密的自我保护机制，一切意图破坏他精神层面的东西反而遭遇他的抵触与攻击。
最终，无计可施。在不二咲千寻各种担心的嘱咐之下，躺在实验舱里的浅川爱梨戴上了精神潜入专用的头盔后，进入了狛枝凪斗的精神世界。
奇怪的是，次次排斥Alter Ego进入的这个精神世界，这次出乎意料包容地敞开着。
在一阵头晕目眩地降落后，浅川爱梨睁开眼睛，映入眼帘的一片朦胧的景色，但有一部分却又很清晰。
浅川爱梨朝着越来越清晰的景色走去，那是一个小区的游乐设施区域。
孩童的嬉闹声径自迎面扑来，她远远地看见一个白发小男孩抱着双膝，孤零零地坐在一个白色的木马上。
浅绿色的眼眸仿佛失去了焦点，那份清澈的黯然显得格外扎眼。
仅凭这一眼，浅川爱梨就认出来那是小时候的狛枝凪斗。
他坚如磐石难以入侵的精神世界，竟是他的童年记忆。